Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slf1Q8R3P9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slf1Q8R3P9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slf1Q8R3P9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slf1Q8R3P9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Slf1Q8R3P9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slf1Q8R3P9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Slf1Q8R3P9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slf1Q8R3P9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Slf1Q8R3P9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slf1Q8R3P9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slf1Q8R3P9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slf1Q8R3P9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slf1Q8R3P9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slf1Q8R3P9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slf1Q8R3P9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slf1Q8R3P9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slf1Q8R3P9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slf1Q8R3P9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Slf1Q8R3P9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slf1Q8R3P9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slf1Q8R3P9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Slf1Q8R3P9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slf1Q8R3P9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slf1Q8R3P9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slf1Q8R3P9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Slf1Q8R3P9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slf1Q8R3P9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slf1Q8R3P9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slf1Q8R3P9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slf1Q8R3P9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slf1Q8R3P9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slf1Q8R3P9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Slf1Q8R3P9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slf1Q8R3P9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slf1Q8R3P9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slf1Q8R3P9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slf1Q8R3P9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slf1Q8R3P9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slf1Q8R3P9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slf1Q8R3P9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slf1Q8R3P9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slf1Q8R3P9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slf1Q8R3P9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slf1Q8R3P9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slf1Q8R3P9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slf1Q8R3P9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slf1Q8R3P9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slf1Q8R3P9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slf1Q8R3P9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slf1Q8R3P9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slf1Q8R3P9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slf1Q8R3P9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slf1Q8R3P9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slf1Q8R3P9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slf1Q8R3P9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slf1Q8R3P9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slf1Q8R3P9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slf1Q8R3P9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slf1Q8R3P9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slf1Q8R3P9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Slf1Q8R3P9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Slf1Q8R3P9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Slf1Q8R3P9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slf1Q8R3P9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slf1Q8R3P9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slf1Q8R3P9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Slf1Q8R3P9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Slf1Q8R3P9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slf1Q8R3P9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slf1Q8R3P9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Slf1Q8R3P9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slf1Q8R3P9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Slf1Q8R3P9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slf1Q8R3P9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slf1Q8R3P9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slf1Q8R3P9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slf1Q8R3P9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slf1Q8R3P9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slf1Q8R3P9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slf1Q8R3P9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slf1Q8R3P9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slf1Q8R3P9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slf1Q8R3P9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slf1Q8R3P9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slf1Q8R3P9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slf1Q8R3P9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Slf1Q8R3P9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slf1Q8R3P9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slf1Q8R3P9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slf1Q8R3P9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slf1Q8R3P9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slf1Q8R3P9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slf1Q8R3P9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slf1Q8R3P9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slf1Q8R3P9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slf1Q8R3P9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slf1Q8R3P9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slf1Q8R3P9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slf1Q8R3P9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms