Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2P1

Klhl25, Kelch-like protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl25Q8R2P1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhl25Q8R2P1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klhl25Q8R2P1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Klhl25Q8R2P1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klhl25Q8R2P1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Klhl25Q8R2P1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Klhl25Q8R2P1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhl25Q8R2P1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhl25Q8R2P1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhl25Q8R2P1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klhl25Q8R2P1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl25Q8R2P1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Klhl25Q8R2P1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klhl25Q8R2P1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klhl25Q8R2P1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klhl25Q8R2P1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhl25Q8R2P1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Klhl25Q8R2P1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhl25Q8R2P1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhl25Q8R2P1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhl25Q8R2P1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhl25Q8R2P1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klhl25Q8R2P1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klhl25Q8R2P1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Klhl25Q8R2P1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhl25Q8R2P1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhl25Q8R2P1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klhl25Q8R2P1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klhl25Q8R2P1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhl25Q8R2P1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klhl25Q8R2P1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klhl25Q8R2P1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klhl25Q8R2P1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhl25Q8R2P1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klhl25Q8R2P1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhl25Q8R2P1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhl25Q8R2P1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klhl25Q8R2P1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klhl25Q8R2P1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhl25Q8R2P1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Klhl25Q8R2P1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhl25Q8R2P1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhl25Q8R2P1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Klhl25Q8R2P1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Klhl25Q8R2P1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Klhl25Q8R2P1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Klhl25Q8R2P1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl25Q8R2P1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klhl25Q8R2P1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Klhl25Q8R2P1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Klhl25Q8R2P1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhl25Q8R2P1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhl25Q8R2P1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhl25Q8R2P1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhl25Q8R2P1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhl25Q8R2P1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klhl25Q8R2P1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl25Q8R2P1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl25Q8R2P1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhl25Q8R2P1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl25Q8R2P1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl25Q8R2P1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl25Q8R2P1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl25Q8R2P1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhl25Q8R2P1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhl25Q8R2P1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhl25Q8R2P1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl25Q8R2P1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl25Q8R2P1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhl25Q8R2P1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhl25Q8R2P1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhl25Q8R2P1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl25Q8R2P1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl25Q8R2P1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl25Q8R2P1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl25Q8R2P1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klhl25Q8R2P1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Klhl25Q8R2P1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl25Q8R2P1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl25Q8R2P1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl25Q8R2P1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl25Q8R2P1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl25Q8R2P1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl25Q8R2P1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl25Q8R2P1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl25Q8R2P1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl25Q8R2P1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhl25Q8R2P1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl25Q8R2P1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl25Q8R2P1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl25Q8R2P1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl25Q8R2P1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl25Q8R2P1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl25Q8R2P1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl25Q8R2P1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl25Q8R2P1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl25Q8R2P1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl25Q8R2P1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl25Q8R2P1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl25Q8R2P1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms