Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RorbQ8R1B8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RorbQ8R1B8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RorbQ8R1B8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RorbQ8R1B8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RorbQ8R1B8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RorbQ8R1B8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RorbQ8R1B8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RorbQ8R1B8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RorbQ8R1B8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RorbQ8R1B8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RorbQ8R1B8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RorbQ8R1B8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RorbQ8R1B8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RorbQ8R1B8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RorbQ8R1B8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RorbQ8R1B8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RorbQ8R1B8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RorbQ8R1B8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RorbQ8R1B8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RorbQ8R1B8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RorbQ8R1B8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RorbQ8R1B8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RorbQ8R1B8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RorbQ8R1B8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RorbQ8R1B8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RorbQ8R1B8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RorbQ8R1B8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RorbQ8R1B8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RorbQ8R1B8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RorbQ8R1B8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RorbQ8R1B8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RorbQ8R1B8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RorbQ8R1B8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RorbQ8R1B8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RorbQ8R1B8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RorbQ8R1B8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RorbQ8R1B8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RorbQ8R1B8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RorbQ8R1B8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RorbQ8R1B8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RorbQ8R1B8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RorbQ8R1B8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RorbQ8R1B8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RorbQ8R1B8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RorbQ8R1B8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RorbQ8R1B8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RorbQ8R1B8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RorbQ8R1B8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RorbQ8R1B8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RorbQ8R1B8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RorbQ8R1B8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RorbQ8R1B8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RorbQ8R1B8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RorbQ8R1B8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RorbQ8R1B8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RorbQ8R1B8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RorbQ8R1B8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RorbQ8R1B8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RorbQ8R1B8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RorbQ8R1B8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RorbQ8R1B8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RorbQ8R1B8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RorbQ8R1B8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RorbQ8R1B8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RorbQ8R1B8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RorbQ8R1B8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RorbQ8R1B8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RorbQ8R1B8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RorbQ8R1B8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RorbQ8R1B8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RorbQ8R1B8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RorbQ8R1B8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RorbQ8R1B8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RorbQ8R1B8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RorbQ8R1B8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RorbQ8R1B8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RorbQ8R1B8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RorbQ8R1B8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RorbQ8R1B8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RorbQ8R1B8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RorbQ8R1B8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RorbQ8R1B8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RorbQ8R1B8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RorbQ8R1B8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RorbQ8R1B8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RorbQ8R1B8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RorbQ8R1B8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RorbQ8R1B8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RorbQ8R1B8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RorbQ8R1B8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RorbQ8R1B8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RorbQ8R1B8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RorbQ8R1B8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RorbQ8R1B8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RorbQ8R1B8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RorbQ8R1B8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RorbQ8R1B8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RorbQ8R1B8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RorbQ8R1B8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms