Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rassf9Q8K342 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rassf9Q8K342 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Rassf9Q8K342 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rassf9Q8K342 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rassf9Q8K342 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rassf9Q8K342 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rassf9Q8K342 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rassf9Q8K342 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rassf9Q8K342 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rassf9Q8K342 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rassf9Q8K342 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rassf9Q8K342 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rassf9Q8K342 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rassf9Q8K342 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rassf9Q8K342 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rassf9Q8K342 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rassf9Q8K342 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rassf9Q8K342 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rassf9Q8K342 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rassf9Q8K342 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rassf9Q8K342 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rassf9Q8K342 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rassf9Q8K342 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rassf9Q8K342 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Rassf9Q8K342 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rassf9Q8K342 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rassf9Q8K342 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rassf9Q8K342 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rassf9Q8K342 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rassf9Q8K342 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rassf9Q8K342 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rassf9Q8K342 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rassf9Q8K342 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rassf9Q8K342 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rassf9Q8K342 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rassf9Q8K342 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rassf9Q8K342 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rassf9Q8K342 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Rassf9Q8K342 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rassf9Q8K342 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rassf9Q8K342 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rassf9Q8K342 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rassf9Q8K342 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rassf9Q8K342 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rassf9Q8K342 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rassf9Q8K342 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rassf9Q8K342 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rassf9Q8K342 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rassf9Q8K342 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rassf9Q8K342 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rassf9Q8K342 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rassf9Q8K342 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rassf9Q8K342 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rassf9Q8K342 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Rassf9Q8K342 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rassf9Q8K342 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rassf9Q8K342 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rassf9Q8K342 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rassf9Q8K342 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rassf9Q8K342 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rassf9Q8K342 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rassf9Q8K342 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rassf9Q8K342 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rassf9Q8K342 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rassf9Q8K342 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rassf9Q8K342 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rassf9Q8K342 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rassf9Q8K342 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rassf9Q8K342 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rassf9Q8K342 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rassf9Q8K342 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rassf9Q8K342 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rassf9Q8K342 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rassf9Q8K342 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rassf9Q8K342 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rassf9Q8K342 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rassf9Q8K342 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rassf9Q8K342 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rassf9Q8K342 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rassf9Q8K342 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rassf9Q8K342 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rassf9Q8K342 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rassf9Q8K342 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rassf9Q8K342 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rassf9Q8K342 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rassf9Q8K342 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rassf9Q8K342 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rassf9Q8K342 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rassf9Q8K342 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rassf9Q8K342 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rassf9Q8K342 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rassf9Q8K342 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rassf9Q8K342 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rassf9Q8K342 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rassf9Q8K342 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rassf9Q8K342 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rassf9Q8K342 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rassf9Q8K342 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rassf9Q8K342 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms