Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ssh3Q8K330 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ssh3Q8K330 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ssh3Q8K330 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Ssh3Q8K330 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Ssh3Q8K330 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Ssh3Q8K330 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Ssh3Q8K330 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Ssh3Q8K330 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Ssh3Q8K330 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Ssh3Q8K330 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Ssh3Q8K330 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Ssh3Q8K330 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Ssh3Q8K330 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ssh3Q8K330 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Ssh3Q8K330 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ssh3Q8K330 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ssh3Q8K330 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ssh3Q8K330 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ssh3Q8K330 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ssh3Q8K330 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ssh3Q8K330 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ssh3Q8K330 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,83■■□□□ 1,89
Ssh3Q8K330 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ssh3Q8K330 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ssh3Q8K330 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Ssh3Q8K330 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Ssh3Q8K330 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Ssh3Q8K330 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ssh3Q8K330 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ssh3Q8K330 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ssh3Q8K330 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ssh3Q8K330 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,87
Ssh3Q8K330 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ssh3Q8K330 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ssh3Q8K330 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Ssh3Q8K330 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ssh3Q8K330 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ssh3Q8K330 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Ssh3Q8K330 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Ssh3Q8K330 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Ssh3Q8K330 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Ssh3Q8K330 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ssh3Q8K330 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ssh3Q8K330 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Ssh3Q8K330 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Ssh3Q8K330 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Ssh3Q8K330 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ssh3Q8K330 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Ssh3Q8K330 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Ssh3Q8K330 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,52■■□□□ 1,84
Ssh3Q8K330 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,84
Ssh3Q8K330 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Ssh3Q8K330 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Ssh3Q8K330 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ssh3Q8K330 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Ssh3Q8K330 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Ssh3Q8K330 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Ssh3Q8K330 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Ssh3Q8K330 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Ssh3Q8K330 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,33■■□□□ 1,8
Ssh3Q8K330 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26,32■■□□□ 1,8
Ssh3Q8K330 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Ssh3Q8K330 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ssh3Q8K330 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Ssh3Q8K330 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Ssh3Q8K330 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Ssh3Q8K330 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Ssh3Q8K330 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Ssh3Q8K330 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Ssh3Q8K330 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Ssh3Q8K330 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Ssh3Q8K330 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Ssh3Q8K330 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Ssh3Q8K330 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Ssh3Q8K330 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Ssh3Q8K330 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ssh3Q8K330 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ssh3Q8K330 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ssh3Q8K330 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ssh3Q8K330 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ssh3Q8K330 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,14■■□□□ 1,78
Ssh3Q8K330 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Ssh3Q8K330 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Ssh3Q8K330 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Ssh3Q8K330 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Ssh3Q8K330 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,03■■□□□ 1,76
Ssh3Q8K330 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Ssh3Q8K330 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Ssh3Q8K330 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,98■■□□□ 1,75
Ssh3Q8K330 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ssh3Q8K330 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Ssh3Q8K330 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Ssh3Q8K330 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
Ssh3Q8K330 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Ssh3Q8K330 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Ssh3Q8K330 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Ssh3Q8K330 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Ssh3Q8K330 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Ssh3Q8K330 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39,3 ms