Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300eQ8K249 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd300eQ8K249 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300eQ8K249 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300eQ8K249 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd300eQ8K249 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd300eQ8K249 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd300eQ8K249 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300eQ8K249 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300eQ8K249 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300eQ8K249 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd300eQ8K249 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300eQ8K249 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300eQ8K249 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300eQ8K249 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300eQ8K249 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300eQ8K249 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300eQ8K249 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300eQ8K249 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300eQ8K249 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300eQ8K249 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd300eQ8K249 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300eQ8K249 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300eQ8K249 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300eQ8K249 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd300eQ8K249 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd300eQ8K249 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd300eQ8K249 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300eQ8K249 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300eQ8K249 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd300eQ8K249 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd300eQ8K249 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd300eQ8K249 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd300eQ8K249 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd300eQ8K249 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd300eQ8K249 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd300eQ8K249 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd300eQ8K249 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd300eQ8K249 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd300eQ8K249 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300eQ8K249 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300eQ8K249 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd300eQ8K249 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd300eQ8K249 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd300eQ8K249 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300eQ8K249 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300eQ8K249 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300eQ8K249 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd300eQ8K249 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd300eQ8K249 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300eQ8K249 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300eQ8K249 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd300eQ8K249 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd300eQ8K249 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300eQ8K249 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd300eQ8K249 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd300eQ8K249 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300eQ8K249 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300eQ8K249 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300eQ8K249 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd300eQ8K249 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd300eQ8K249 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd300eQ8K249 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd300eQ8K249 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd300eQ8K249 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd300eQ8K249 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd300eQ8K249 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd300eQ8K249 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300eQ8K249 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300eQ8K249 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300eQ8K249 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300eQ8K249 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300eQ8K249 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd300eQ8K249 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd300eQ8K249 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300eQ8K249 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300eQ8K249 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300eQ8K249 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300eQ8K249 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd300eQ8K249 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300eQ8K249 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd300eQ8K249 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300eQ8K249 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300eQ8K249 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300eQ8K249 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300eQ8K249 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd300eQ8K249 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300eQ8K249 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300eQ8K249 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300eQ8K249 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300eQ8K249 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300eQ8K249 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd300eQ8K249 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd300eQ8K249 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd300eQ8K249 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd300eQ8K249 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd300eQ8K249 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd300eQ8K249 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd300eQ8K249 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd300eQ8K249 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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