Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neil3Q8K203 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neil3Q8K203 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neil3Q8K203 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neil3Q8K203 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neil3Q8K203 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neil3Q8K203 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neil3Q8K203 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neil3Q8K203 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neil3Q8K203 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neil3Q8K203 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neil3Q8K203 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neil3Q8K203 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neil3Q8K203 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neil3Q8K203 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neil3Q8K203 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neil3Q8K203 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neil3Q8K203 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neil3Q8K203 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neil3Q8K203 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neil3Q8K203 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neil3Q8K203 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Neil3Q8K203 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neil3Q8K203 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neil3Q8K203 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neil3Q8K203 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neil3Q8K203 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neil3Q8K203 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neil3Q8K203 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neil3Q8K203 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neil3Q8K203 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Neil3Q8K203 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neil3Q8K203 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neil3Q8K203 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neil3Q8K203 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neil3Q8K203 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neil3Q8K203 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neil3Q8K203 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neil3Q8K203 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neil3Q8K203 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Neil3Q8K203 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Neil3Q8K203 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Neil3Q8K203 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Neil3Q8K203 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neil3Q8K203 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neil3Q8K203 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neil3Q8K203 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neil3Q8K203 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neil3Q8K203 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Neil3Q8K203 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Neil3Q8K203 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Neil3Q8K203 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Neil3Q8K203 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neil3Q8K203 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neil3Q8K203 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neil3Q8K203 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neil3Q8K203 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neil3Q8K203 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neil3Q8K203 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neil3Q8K203 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neil3Q8K203 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neil3Q8K203 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neil3Q8K203 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neil3Q8K203 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neil3Q8K203 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neil3Q8K203 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Neil3Q8K203 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neil3Q8K203 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neil3Q8K203 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Neil3Q8K203 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Neil3Q8K203 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neil3Q8K203 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Neil3Q8K203 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Neil3Q8K203 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Neil3Q8K203 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Neil3Q8K203 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Neil3Q8K203 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Neil3Q8K203 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Neil3Q8K203 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Neil3Q8K203 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Neil3Q8K203 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neil3Q8K203 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neil3Q8K203 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neil3Q8K203 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Neil3Q8K203 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neil3Q8K203 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neil3Q8K203 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neil3Q8K203 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neil3Q8K203 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neil3Q8K203 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neil3Q8K203 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neil3Q8K203 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neil3Q8K203 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neil3Q8K203 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neil3Q8K203 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neil3Q8K203 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Neil3Q8K203 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neil3Q8K203 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neil3Q8K203 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neil3Q8K203 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms