Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1K9

Hinfp, Histone H4 transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HinfpQ8K1K9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HinfpQ8K1K9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HinfpQ8K1K9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HinfpQ8K1K9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HinfpQ8K1K9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HinfpQ8K1K9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HinfpQ8K1K9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HinfpQ8K1K9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HinfpQ8K1K9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HinfpQ8K1K9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HinfpQ8K1K9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HinfpQ8K1K9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HinfpQ8K1K9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HinfpQ8K1K9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HinfpQ8K1K9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HinfpQ8K1K9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HinfpQ8K1K9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HinfpQ8K1K9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HinfpQ8K1K9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HinfpQ8K1K9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HinfpQ8K1K9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HinfpQ8K1K9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HinfpQ8K1K9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HinfpQ8K1K9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HinfpQ8K1K9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HinfpQ8K1K9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HinfpQ8K1K9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HinfpQ8K1K9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HinfpQ8K1K9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HinfpQ8K1K9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HinfpQ8K1K9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HinfpQ8K1K9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HinfpQ8K1K9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HinfpQ8K1K9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HinfpQ8K1K9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HinfpQ8K1K9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HinfpQ8K1K9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HinfpQ8K1K9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HinfpQ8K1K9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HinfpQ8K1K9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HinfpQ8K1K9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HinfpQ8K1K9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HinfpQ8K1K9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HinfpQ8K1K9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HinfpQ8K1K9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HinfpQ8K1K9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HinfpQ8K1K9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HinfpQ8K1K9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HinfpQ8K1K9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HinfpQ8K1K9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HinfpQ8K1K9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HinfpQ8K1K9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HinfpQ8K1K9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HinfpQ8K1K9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HinfpQ8K1K9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HinfpQ8K1K9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HinfpQ8K1K9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HinfpQ8K1K9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HinfpQ8K1K9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HinfpQ8K1K9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HinfpQ8K1K9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HinfpQ8K1K9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HinfpQ8K1K9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HinfpQ8K1K9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HinfpQ8K1K9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HinfpQ8K1K9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HinfpQ8K1K9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HinfpQ8K1K9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HinfpQ8K1K9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HinfpQ8K1K9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HinfpQ8K1K9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HinfpQ8K1K9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HinfpQ8K1K9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HinfpQ8K1K9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HinfpQ8K1K9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HinfpQ8K1K9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HinfpQ8K1K9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HinfpQ8K1K9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HinfpQ8K1K9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HinfpQ8K1K9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HinfpQ8K1K9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HinfpQ8K1K9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HinfpQ8K1K9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HinfpQ8K1K9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HinfpQ8K1K9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HinfpQ8K1K9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HinfpQ8K1K9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HinfpQ8K1K9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HinfpQ8K1K9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HinfpQ8K1K9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HinfpQ8K1K9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HinfpQ8K1K9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HinfpQ8K1K9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HinfpQ8K1K9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HinfpQ8K1K9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HinfpQ8K1K9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HinfpQ8K1K9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
HinfpQ8K1K9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HinfpQ8K1K9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HinfpQ8K1K9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms