Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnppd1Q8K158 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnppd1Q8K158 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnppd1Q8K158 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnppd1Q8K158 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnppd1Q8K158 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnppd1Q8K158 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnppd1Q8K158 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnppd1Q8K158 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnppd1Q8K158 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnppd1Q8K158 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnppd1Q8K158 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnppd1Q8K158 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnppd1Q8K158 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnppd1Q8K158 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnppd1Q8K158 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnppd1Q8K158 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnppd1Q8K158 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnppd1Q8K158 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnppd1Q8K158 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnppd1Q8K158 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnppd1Q8K158 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnppd1Q8K158 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnppd1Q8K158 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnppd1Q8K158 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnppd1Q8K158 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnppd1Q8K158 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnppd1Q8K158 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnppd1Q8K158 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnppd1Q8K158 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnppd1Q8K158 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnppd1Q8K158 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnppd1Q8K158 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnppd1Q8K158 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnppd1Q8K158 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnppd1Q8K158 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnppd1Q8K158 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnppd1Q8K158 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnppd1Q8K158 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnppd1Q8K158 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cnppd1Q8K158 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnppd1Q8K158 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnppd1Q8K158 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnppd1Q8K158 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnppd1Q8K158 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnppd1Q8K158 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnppd1Q8K158 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnppd1Q8K158 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnppd1Q8K158 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnppd1Q8K158 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnppd1Q8K158 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnppd1Q8K158 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnppd1Q8K158 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnppd1Q8K158 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnppd1Q8K158 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnppd1Q8K158 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnppd1Q8K158 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnppd1Q8K158 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnppd1Q8K158 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnppd1Q8K158 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnppd1Q8K158 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnppd1Q8K158 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnppd1Q8K158 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnppd1Q8K158 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnppd1Q8K158 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnppd1Q8K158 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnppd1Q8K158 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnppd1Q8K158 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnppd1Q8K158 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnppd1Q8K158 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnppd1Q8K158 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnppd1Q8K158 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnppd1Q8K158 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnppd1Q8K158 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnppd1Q8K158 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnppd1Q8K158 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnppd1Q8K158 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnppd1Q8K158 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnppd1Q8K158 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnppd1Q8K158 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnppd1Q8K158 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnppd1Q8K158 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnppd1Q8K158 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnppd1Q8K158 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnppd1Q8K158 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnppd1Q8K158 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnppd1Q8K158 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnppd1Q8K158 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnppd1Q8K158 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnppd1Q8K158 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnppd1Q8K158 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnppd1Q8K158 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnppd1Q8K158 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnppd1Q8K158 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnppd1Q8K158 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnppd1Q8K158 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnppd1Q8K158 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnppd1Q8K158 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnppd1Q8K158 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnppd1Q8K158 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms