Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIV2

Tmem259, Membralin, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem259Q8CIV2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmem259Q8CIV2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tmem259Q8CIV2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmem259Q8CIV2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmem259Q8CIV2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmem259Q8CIV2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmem259Q8CIV2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmem259Q8CIV2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmem259Q8CIV2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmem259Q8CIV2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmem259Q8CIV2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmem259Q8CIV2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmem259Q8CIV2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmem259Q8CIV2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmem259Q8CIV2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmem259Q8CIV2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmem259Q8CIV2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmem259Q8CIV2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmem259Q8CIV2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmem259Q8CIV2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmem259Q8CIV2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmem259Q8CIV2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmem259Q8CIV2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmem259Q8CIV2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmem259Q8CIV2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmem259Q8CIV2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmem259Q8CIV2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmem259Q8CIV2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmem259Q8CIV2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmem259Q8CIV2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmem259Q8CIV2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmem259Q8CIV2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmem259Q8CIV2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmem259Q8CIV2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmem259Q8CIV2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tmem259Q8CIV2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmem259Q8CIV2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmem259Q8CIV2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmem259Q8CIV2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmem259Q8CIV2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmem259Q8CIV2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmem259Q8CIV2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmem259Q8CIV2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmem259Q8CIV2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmem259Q8CIV2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmem259Q8CIV2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmem259Q8CIV2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmem259Q8CIV2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmem259Q8CIV2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmem259Q8CIV2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmem259Q8CIV2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tmem259Q8CIV2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmem259Q8CIV2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmem259Q8CIV2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmem259Q8CIV2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmem259Q8CIV2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmem259Q8CIV2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmem259Q8CIV2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Tmem259Q8CIV2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmem259Q8CIV2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmem259Q8CIV2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmem259Q8CIV2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmem259Q8CIV2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmem259Q8CIV2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmem259Q8CIV2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmem259Q8CIV2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmem259Q8CIV2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmem259Q8CIV2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmem259Q8CIV2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmem259Q8CIV2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmem259Q8CIV2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmem259Q8CIV2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmem259Q8CIV2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem259Q8CIV2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Tmem259Q8CIV2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmem259Q8CIV2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmem259Q8CIV2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmem259Q8CIV2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmem259Q8CIV2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmem259Q8CIV2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmem259Q8CIV2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmem259Q8CIV2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmem259Q8CIV2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmem259Q8CIV2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmem259Q8CIV2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmem259Q8CIV2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem259Q8CIV2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem259Q8CIV2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmem259Q8CIV2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmem259Q8CIV2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tmem259Q8CIV2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmem259Q8CIV2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmem259Q8CIV2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem259Q8CIV2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmem259Q8CIV2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmem259Q8CIV2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmem259Q8CIV2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmem259Q8CIV2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmem259Q8CIV2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmem259Q8CIV2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms