Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SbsnQ8CIT9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SbsnQ8CIT9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SbsnQ8CIT9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SbsnQ8CIT9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SbsnQ8CIT9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SbsnQ8CIT9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SbsnQ8CIT9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SbsnQ8CIT9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SbsnQ8CIT9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SbsnQ8CIT9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SbsnQ8CIT9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SbsnQ8CIT9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SbsnQ8CIT9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SbsnQ8CIT9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SbsnQ8CIT9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SbsnQ8CIT9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SbsnQ8CIT9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SbsnQ8CIT9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SbsnQ8CIT9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SbsnQ8CIT9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SbsnQ8CIT9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SbsnQ8CIT9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SbsnQ8CIT9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SbsnQ8CIT9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SbsnQ8CIT9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SbsnQ8CIT9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SbsnQ8CIT9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SbsnQ8CIT9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SbsnQ8CIT9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SbsnQ8CIT9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SbsnQ8CIT9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SbsnQ8CIT9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SbsnQ8CIT9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SbsnQ8CIT9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SbsnQ8CIT9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SbsnQ8CIT9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SbsnQ8CIT9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SbsnQ8CIT9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SbsnQ8CIT9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SbsnQ8CIT9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SbsnQ8CIT9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SbsnQ8CIT9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SbsnQ8CIT9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SbsnQ8CIT9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SbsnQ8CIT9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SbsnQ8CIT9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SbsnQ8CIT9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SbsnQ8CIT9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SbsnQ8CIT9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SbsnQ8CIT9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SbsnQ8CIT9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SbsnQ8CIT9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SbsnQ8CIT9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SbsnQ8CIT9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SbsnQ8CIT9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SbsnQ8CIT9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SbsnQ8CIT9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SbsnQ8CIT9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SbsnQ8CIT9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SbsnQ8CIT9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SbsnQ8CIT9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SbsnQ8CIT9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SbsnQ8CIT9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SbsnQ8CIT9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SbsnQ8CIT9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SbsnQ8CIT9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SbsnQ8CIT9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SbsnQ8CIT9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SbsnQ8CIT9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SbsnQ8CIT9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SbsnQ8CIT9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SbsnQ8CIT9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SbsnQ8CIT9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SbsnQ8CIT9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SbsnQ8CIT9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SbsnQ8CIT9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SbsnQ8CIT9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SbsnQ8CIT9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SbsnQ8CIT9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SbsnQ8CIT9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SbsnQ8CIT9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SbsnQ8CIT9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SbsnQ8CIT9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SbsnQ8CIT9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SbsnQ8CIT9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SbsnQ8CIT9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SbsnQ8CIT9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SbsnQ8CIT9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SbsnQ8CIT9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SbsnQ8CIT9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SbsnQ8CIT9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SbsnQ8CIT9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SbsnQ8CIT9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SbsnQ8CIT9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SbsnQ8CIT9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SbsnQ8CIT9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SbsnQ8CIT9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SbsnQ8CIT9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SbsnQ8CIT9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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