Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps50Q8CI71 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps50Q8CI71 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps50Q8CI71 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Vps50Q8CI71 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps50Q8CI71 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps50Q8CI71 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps50Q8CI71 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps50Q8CI71 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps50Q8CI71 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Vps50Q8CI71 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps50Q8CI71 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps50Q8CI71 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps50Q8CI71 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps50Q8CI71 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps50Q8CI71 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps50Q8CI71 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps50Q8CI71 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps50Q8CI71 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Vps50Q8CI71 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps50Q8CI71 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps50Q8CI71 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps50Q8CI71 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps50Q8CI71 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps50Q8CI71 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps50Q8CI71 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps50Q8CI71 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps50Q8CI71 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps50Q8CI71 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps50Q8CI71 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps50Q8CI71 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps50Q8CI71 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps50Q8CI71 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps50Q8CI71 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps50Q8CI71 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps50Q8CI71 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps50Q8CI71 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps50Q8CI71 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps50Q8CI71 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps50Q8CI71 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps50Q8CI71 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps50Q8CI71 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps50Q8CI71 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps50Q8CI71 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps50Q8CI71 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps50Q8CI71 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps50Q8CI71 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps50Q8CI71 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps50Q8CI71 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps50Q8CI71 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps50Q8CI71 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps50Q8CI71 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps50Q8CI71 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps50Q8CI71 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps50Q8CI71 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps50Q8CI71 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps50Q8CI71 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps50Q8CI71 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps50Q8CI71 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps50Q8CI71 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps50Q8CI71 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps50Q8CI71 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps50Q8CI71 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps50Q8CI71 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps50Q8CI71 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps50Q8CI71 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps50Q8CI71 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vps50Q8CI71 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps50Q8CI71 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps50Q8CI71 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps50Q8CI71 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps50Q8CI71 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps50Q8CI71 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps50Q8CI71 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps50Q8CI71 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps50Q8CI71 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps50Q8CI71 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps50Q8CI71 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps50Q8CI71 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps50Q8CI71 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps50Q8CI71 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps50Q8CI71 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps50Q8CI71 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps50Q8CI71 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps50Q8CI71 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps50Q8CI71 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps50Q8CI71 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps50Q8CI71 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps50Q8CI71 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps50Q8CI71 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps50Q8CI71 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps50Q8CI71 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps50Q8CI71 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps50Q8CI71 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps50Q8CI71 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps50Q8CI71 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps50Q8CI71 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps50Q8CI71 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps50Q8CI71 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps50Q8CI71 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms