Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Snx8Q8CFD4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Snx8Q8CFD4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Snx8Q8CFD4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Snx8Q8CFD4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Snx8Q8CFD4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Snx8Q8CFD4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Snx8Q8CFD4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Snx8Q8CFD4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Snx8Q8CFD4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Snx8Q8CFD4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Snx8Q8CFD4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Snx8Q8CFD4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Snx8Q8CFD4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Snx8Q8CFD4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Snx8Q8CFD4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Snx8Q8CFD4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Snx8Q8CFD4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Snx8Q8CFD4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Snx8Q8CFD4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Snx8Q8CFD4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,75■■□□□ 1,87
Snx8Q8CFD4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Snx8Q8CFD4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Snx8Q8CFD4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Snx8Q8CFD4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Snx8Q8CFD4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Snx8Q8CFD4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Snx8Q8CFD4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Snx8Q8CFD4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Snx8Q8CFD4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Snx8Q8CFD4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Snx8Q8CFD4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Snx8Q8CFD4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Snx8Q8CFD4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Snx8Q8CFD4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Snx8Q8CFD4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Snx8Q8CFD4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Snx8Q8CFD4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,49■■□□□ 1,83
Snx8Q8CFD4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Snx8Q8CFD4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Snx8Q8CFD4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Snx8Q8CFD4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Snx8Q8CFD4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,43■■□□□ 1,82
Snx8Q8CFD4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Snx8Q8CFD4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Snx8Q8CFD4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Snx8Q8CFD4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Snx8Q8CFD4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Snx8Q8CFD4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Snx8Q8CFD4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Snx8Q8CFD4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Snx8Q8CFD4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Snx8Q8CFD4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Snx8Q8CFD4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Snx8Q8CFD4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Snx8Q8CFD4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Snx8Q8CFD4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26,21■■□□□ 1,79
Snx8Q8CFD4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Snx8Q8CFD4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Snx8Q8CFD4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Snx8Q8CFD4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Snx8Q8CFD4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Snx8Q8CFD4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Snx8Q8CFD4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Snx8Q8CFD4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Snx8Q8CFD4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Snx8Q8CFD4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Snx8Q8CFD4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Snx8Q8CFD4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
Snx8Q8CFD4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Snx8Q8CFD4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Snx8Q8CFD4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Snx8Q8CFD4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,01■■□□□ 1,76
Snx8Q8CFD4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,76
Snx8Q8CFD4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Snx8Q8CFD4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Snx8Q8CFD4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,98■■□□□ 1,75
Snx8Q8CFD4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Snx8Q8CFD4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Snx8Q8CFD4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Snx8Q8CFD4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Snx8Q8CFD4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Snx8Q8CFD4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Snx8Q8CFD4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Snx8Q8CFD4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,89■■□□□ 1,74
Snx8Q8CFD4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Snx8Q8CFD4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Snx8Q8CFD4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
Snx8Q8CFD4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Snx8Q8CFD4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,87■■□□□ 1,73
Snx8Q8CFD4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Snx8Q8CFD4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Snx8Q8CFD4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Snx8Q8CFD4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Snx8Q8CFD4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Snx8Q8CFD4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Snx8Q8CFD4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Snx8Q8CFD4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Snx8Q8CFD4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Snx8Q8CFD4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,77■■□□□ 1,72
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