Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx8Q8CFD4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx8Q8CFD4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx8Q8CFD4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snx8Q8CFD4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx8Q8CFD4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx8Q8CFD4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snx8Q8CFD4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snx8Q8CFD4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Snx8Q8CFD4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx8Q8CFD4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx8Q8CFD4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx8Q8CFD4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snx8Q8CFD4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx8Q8CFD4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx8Q8CFD4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx8Q8CFD4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snx8Q8CFD4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx8Q8CFD4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snx8Q8CFD4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx8Q8CFD4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx8Q8CFD4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx8Q8CFD4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx8Q8CFD4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snx8Q8CFD4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx8Q8CFD4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snx8Q8CFD4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx8Q8CFD4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx8Q8CFD4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx8Q8CFD4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snx8Q8CFD4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx8Q8CFD4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx8Q8CFD4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snx8Q8CFD4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx8Q8CFD4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx8Q8CFD4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snx8Q8CFD4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snx8Q8CFD4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx8Q8CFD4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx8Q8CFD4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snx8Q8CFD4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx8Q8CFD4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx8Q8CFD4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx8Q8CFD4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snx8Q8CFD4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snx8Q8CFD4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snx8Q8CFD4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx8Q8CFD4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snx8Q8CFD4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx8Q8CFD4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx8Q8CFD4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx8Q8CFD4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx8Q8CFD4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Snx8Q8CFD4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snx8Q8CFD4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx8Q8CFD4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snx8Q8CFD4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx8Q8CFD4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snx8Q8CFD4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx8Q8CFD4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx8Q8CFD4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx8Q8CFD4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx8Q8CFD4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx8Q8CFD4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx8Q8CFD4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx8Q8CFD4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx8Q8CFD4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx8Q8CFD4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx8Q8CFD4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx8Q8CFD4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx8Q8CFD4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx8Q8CFD4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snx8Q8CFD4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Snx8Q8CFD4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Snx8Q8CFD4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx8Q8CFD4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx8Q8CFD4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx8Q8CFD4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx8Q8CFD4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx8Q8CFD4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snx8Q8CFD4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx8Q8CFD4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx8Q8CFD4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx8Q8CFD4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx8Q8CFD4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx8Q8CFD4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx8Q8CFD4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx8Q8CFD4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx8Q8CFD4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx8Q8CFD4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx8Q8CFD4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx8Q8CFD4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx8Q8CFD4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx8Q8CFD4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx8Q8CFD4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx8Q8CFD4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx8Q8CFD4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx8Q8CFD4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx8Q8CFD4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx8Q8CFD4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
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