Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN6

Txnl1, Thioredoxin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnl1Q8CDN6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Txnl1Q8CDN6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Txnl1Q8CDN6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Txnl1Q8CDN6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Txnl1Q8CDN6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Txnl1Q8CDN6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnl1Q8CDN6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnl1Q8CDN6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnl1Q8CDN6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Txnl1Q8CDN6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Txnl1Q8CDN6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Txnl1Q8CDN6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Txnl1Q8CDN6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Txnl1Q8CDN6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Txnl1Q8CDN6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Txnl1Q8CDN6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txnl1Q8CDN6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Txnl1Q8CDN6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnl1Q8CDN6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnl1Q8CDN6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnl1Q8CDN6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnl1Q8CDN6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnl1Q8CDN6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnl1Q8CDN6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnl1Q8CDN6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnl1Q8CDN6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Txnl1Q8CDN6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Txnl1Q8CDN6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Txnl1Q8CDN6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Txnl1Q8CDN6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Txnl1Q8CDN6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Txnl1Q8CDN6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Txnl1Q8CDN6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Txnl1Q8CDN6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Txnl1Q8CDN6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Txnl1Q8CDN6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Txnl1Q8CDN6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Txnl1Q8CDN6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Txnl1Q8CDN6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Txnl1Q8CDN6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Txnl1Q8CDN6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Txnl1Q8CDN6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Txnl1Q8CDN6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Txnl1Q8CDN6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Txnl1Q8CDN6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Txnl1Q8CDN6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Txnl1Q8CDN6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnl1Q8CDN6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Txnl1Q8CDN6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Txnl1Q8CDN6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Txnl1Q8CDN6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Txnl1Q8CDN6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Txnl1Q8CDN6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Txnl1Q8CDN6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Txnl1Q8CDN6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Txnl1Q8CDN6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Txnl1Q8CDN6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Txnl1Q8CDN6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Txnl1Q8CDN6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Txnl1Q8CDN6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Txnl1Q8CDN6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Txnl1Q8CDN6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Txnl1Q8CDN6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Txnl1Q8CDN6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Txnl1Q8CDN6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Txnl1Q8CDN6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Txnl1Q8CDN6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Txnl1Q8CDN6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Txnl1Q8CDN6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Txnl1Q8CDN6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Txnl1Q8CDN6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Txnl1Q8CDN6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Txnl1Q8CDN6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Txnl1Q8CDN6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Txnl1Q8CDN6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Txnl1Q8CDN6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Txnl1Q8CDN6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Txnl1Q8CDN6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Txnl1Q8CDN6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Txnl1Q8CDN6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Txnl1Q8CDN6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Txnl1Q8CDN6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Txnl1Q8CDN6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Txnl1Q8CDN6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Txnl1Q8CDN6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Txnl1Q8CDN6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Txnl1Q8CDN6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Txnl1Q8CDN6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Txnl1Q8CDN6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Txnl1Q8CDN6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Txnl1Q8CDN6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Txnl1Q8CDN6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Txnl1Q8CDN6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Txnl1Q8CDN6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Txnl1Q8CDN6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Txnl1Q8CDN6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Txnl1Q8CDN6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Txnl1Q8CDN6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Txnl1Q8CDN6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Txnl1Q8CDN6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms