Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc73Q8CDM4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc73Q8CDM4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc73Q8CDM4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc73Q8CDM4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc73Q8CDM4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc73Q8CDM4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc73Q8CDM4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc73Q8CDM4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc73Q8CDM4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc73Q8CDM4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc73Q8CDM4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc73Q8CDM4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc73Q8CDM4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc73Q8CDM4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc73Q8CDM4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc73Q8CDM4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc73Q8CDM4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc73Q8CDM4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc73Q8CDM4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc73Q8CDM4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc73Q8CDM4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc73Q8CDM4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc73Q8CDM4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc73Q8CDM4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc73Q8CDM4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc73Q8CDM4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc73Q8CDM4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc73Q8CDM4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc73Q8CDM4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc73Q8CDM4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc73Q8CDM4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc73Q8CDM4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc73Q8CDM4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc73Q8CDM4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc73Q8CDM4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc73Q8CDM4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc73Q8CDM4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc73Q8CDM4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc73Q8CDM4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc73Q8CDM4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc73Q8CDM4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc73Q8CDM4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc73Q8CDM4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc73Q8CDM4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc73Q8CDM4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc73Q8CDM4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc73Q8CDM4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc73Q8CDM4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc73Q8CDM4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc73Q8CDM4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc73Q8CDM4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc73Q8CDM4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc73Q8CDM4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc73Q8CDM4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc73Q8CDM4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc73Q8CDM4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc73Q8CDM4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc73Q8CDM4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc73Q8CDM4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc73Q8CDM4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc73Q8CDM4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc73Q8CDM4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc73Q8CDM4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc73Q8CDM4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc73Q8CDM4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc73Q8CDM4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc73Q8CDM4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc73Q8CDM4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc73Q8CDM4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc73Q8CDM4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc73Q8CDM4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc73Q8CDM4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc73Q8CDM4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc73Q8CDM4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc73Q8CDM4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc73Q8CDM4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc73Q8CDM4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc73Q8CDM4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc73Q8CDM4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc73Q8CDM4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc73Q8CDM4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc73Q8CDM4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc73Q8CDM4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc73Q8CDM4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc73Q8CDM4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc73Q8CDM4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc73Q8CDM4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc73Q8CDM4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc73Q8CDM4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc73Q8CDM4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc73Q8CDM4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc73Q8CDM4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc73Q8CDM4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc73Q8CDM4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc73Q8CDM4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc73Q8CDM4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc73Q8CDM4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc73Q8CDM4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms