Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ccdc87Q8CDL9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Ccdc87Q8CDL9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Ccdc87Q8CDL9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Ccdc87Q8CDL9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Ccdc87Q8CDL9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Ccdc87Q8CDL9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Ccdc87Q8CDL9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Ccdc87Q8CDL9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ccdc87Q8CDL9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ccdc87Q8CDL9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Ccdc87Q8CDL9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Ccdc87Q8CDL9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Ccdc87Q8CDL9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Ccdc87Q8CDL9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Ccdc87Q8CDL9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Ccdc87Q8CDL9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Ccdc87Q8CDL9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Ccdc87Q8CDL9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Ccdc87Q8CDL9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Ccdc87Q8CDL9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Ccdc87Q8CDL9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ccdc87Q8CDL9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ccdc87Q8CDL9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ccdc87Q8CDL9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Ccdc87Q8CDL9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Ccdc87Q8CDL9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ccdc87Q8CDL9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ccdc87Q8CDL9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Ccdc87Q8CDL9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Ccdc87Q8CDL9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Ccdc87Q8CDL9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Ccdc87Q8CDL9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ccdc87Q8CDL9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ccdc87Q8CDL9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ccdc87Q8CDL9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ccdc87Q8CDL9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Ccdc87Q8CDL9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ccdc87Q8CDL9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Ccdc87Q8CDL9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ccdc87Q8CDL9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ccdc87Q8CDL9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Ccdc87Q8CDL9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Ccdc87Q8CDL9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Ccdc87Q8CDL9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Ccdc87Q8CDL9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,14■■■□□ 2,09
Ccdc87Q8CDL9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Ccdc87Q8CDL9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Ccdc87Q8CDL9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
Ccdc87Q8CDL9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ccdc87Q8CDL9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Ccdc87Q8CDL9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ccdc87Q8CDL9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Ccdc87Q8CDL9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ccdc87Q8CDL9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ccdc87Q8CDL9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ccdc87Q8CDL9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ccdc87Q8CDL9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28■■■□□ 2,07
Ccdc87Q8CDL9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ccdc87Q8CDL9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ccdc87Q8CDL9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
Ccdc87Q8CDL9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
Ccdc87Q8CDL9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ccdc87Q8CDL9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ccdc87Q8CDL9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Ccdc87Q8CDL9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ccdc87Q8CDL9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Ccdc87Q8CDL9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ccdc87Q8CDL9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ccdc87Q8CDL9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ccdc87Q8CDL9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ccdc87Q8CDL9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,04
Ccdc87Q8CDL9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ccdc87Q8CDL9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ccdc87Q8CDL9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ccdc87Q8CDL9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ccdc87Q8CDL9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Ccdc87Q8CDL9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Ccdc87Q8CDL9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Ccdc87Q8CDL9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ccdc87Q8CDL9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ccdc87Q8CDL9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ccdc87Q8CDL9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ccdc87Q8CDL9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ccdc87Q8CDL9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ccdc87Q8CDL9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ccdc87Q8CDL9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Ccdc87Q8CDL9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ccdc87Q8CDL9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ccdc87Q8CDL9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ccdc87Q8CDL9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
Ccdc87Q8CDL9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ccdc87Q8CDL9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
Ccdc87Q8CDL9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms