Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
6030452D12RikQ8CD33 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
6030452D12RikQ8CD33 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
6030452D12RikQ8CD33 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
6030452D12RikQ8CD33 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
6030452D12RikQ8CD33 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
6030452D12RikQ8CD33 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
6030452D12RikQ8CD33 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
6030452D12RikQ8CD33 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
6030452D12RikQ8CD33 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
6030452D12RikQ8CD33 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
6030452D12RikQ8CD33 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
6030452D12RikQ8CD33 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
6030452D12RikQ8CD33 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
6030452D12RikQ8CD33 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
6030452D12RikQ8CD33 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
6030452D12RikQ8CD33 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
6030452D12RikQ8CD33 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
6030452D12RikQ8CD33 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
6030452D12RikQ8CD33 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
6030452D12RikQ8CD33 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
6030452D12RikQ8CD33 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
6030452D12RikQ8CD33 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
6030452D12RikQ8CD33 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
6030452D12RikQ8CD33 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
6030452D12RikQ8CD33 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
6030452D12RikQ8CD33 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
6030452D12RikQ8CD33 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
6030452D12RikQ8CD33 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
6030452D12RikQ8CD33 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
6030452D12RikQ8CD33 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
6030452D12RikQ8CD33 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
6030452D12RikQ8CD33 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
6030452D12RikQ8CD33 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
6030452D12RikQ8CD33 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
6030452D12RikQ8CD33 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
6030452D12RikQ8CD33 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
6030452D12RikQ8CD33 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
6030452D12RikQ8CD33 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
6030452D12RikQ8CD33 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
6030452D12RikQ8CD33 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
6030452D12RikQ8CD33 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
6030452D12RikQ8CD33 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
6030452D12RikQ8CD33 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
6030452D12RikQ8CD33 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
6030452D12RikQ8CD33 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
6030452D12RikQ8CD33 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
6030452D12RikQ8CD33 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
6030452D12RikQ8CD33 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
6030452D12RikQ8CD33 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
6030452D12RikQ8CD33 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
6030452D12RikQ8CD33 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
6030452D12RikQ8CD33 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
6030452D12RikQ8CD33 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
6030452D12RikQ8CD33 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
6030452D12RikQ8CD33 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
6030452D12RikQ8CD33 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
6030452D12RikQ8CD33 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
6030452D12RikQ8CD33 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
6030452D12RikQ8CD33 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
6030452D12RikQ8CD33 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
6030452D12RikQ8CD33 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
6030452D12RikQ8CD33 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
6030452D12RikQ8CD33 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
6030452D12RikQ8CD33 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
6030452D12RikQ8CD33 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
6030452D12RikQ8CD33 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
6030452D12RikQ8CD33 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
6030452D12RikQ8CD33 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
6030452D12RikQ8CD33 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
6030452D12RikQ8CD33 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
6030452D12RikQ8CD33 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6030452D12RikQ8CD33 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6030452D12RikQ8CD33 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6030452D12RikQ8CD33 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
6030452D12RikQ8CD33 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6030452D12RikQ8CD33 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6030452D12RikQ8CD33 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
6030452D12RikQ8CD33 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6030452D12RikQ8CD33 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
6030452D12RikQ8CD33 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6030452D12RikQ8CD33 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6030452D12RikQ8CD33 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
6030452D12RikQ8CD33 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
6030452D12RikQ8CD33 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
6030452D12RikQ8CD33 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
6030452D12RikQ8CD33 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
6030452D12RikQ8CD33 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
6030452D12RikQ8CD33 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
6030452D12RikQ8CD33 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
6030452D12RikQ8CD33 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
6030452D12RikQ8CD33 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
6030452D12RikQ8CD33 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
6030452D12RikQ8CD33 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
6030452D12RikQ8CD33 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6030452D12RikQ8CD33 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6030452D12RikQ8CD33 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
6030452D12RikQ8CD33 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6030452D12RikQ8CD33 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6030452D12RikQ8CD33 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms