Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SynpoQ8CC35 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SynpoQ8CC35 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SynpoQ8CC35 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SynpoQ8CC35 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SynpoQ8CC35 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SynpoQ8CC35 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SynpoQ8CC35 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SynpoQ8CC35 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SynpoQ8CC35 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SynpoQ8CC35 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SynpoQ8CC35 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SynpoQ8CC35 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SynpoQ8CC35 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SynpoQ8CC35 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SynpoQ8CC35 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SynpoQ8CC35 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SynpoQ8CC35 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynpoQ8CC35 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SynpoQ8CC35 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SynpoQ8CC35 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SynpoQ8CC35 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SynpoQ8CC35 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SynpoQ8CC35 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SynpoQ8CC35 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynpoQ8CC35 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SynpoQ8CC35 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SynpoQ8CC35 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SynpoQ8CC35 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SynpoQ8CC35 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SynpoQ8CC35 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SynpoQ8CC35 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SynpoQ8CC35 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SynpoQ8CC35 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SynpoQ8CC35 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SynpoQ8CC35 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SynpoQ8CC35 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SynpoQ8CC35 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SynpoQ8CC35 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SynpoQ8CC35 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynpoQ8CC35 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynpoQ8CC35 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SynpoQ8CC35 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SynpoQ8CC35 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SynpoQ8CC35 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SynpoQ8CC35 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynpoQ8CC35 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynpoQ8CC35 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SynpoQ8CC35 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SynpoQ8CC35 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynpoQ8CC35 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynpoQ8CC35 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynpoQ8CC35 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynpoQ8CC35 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynpoQ8CC35 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SynpoQ8CC35 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SynpoQ8CC35 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SynpoQ8CC35 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SynpoQ8CC35 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SynpoQ8CC35 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SynpoQ8CC35 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynpoQ8CC35 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynpoQ8CC35 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SynpoQ8CC35 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SynpoQ8CC35 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SynpoQ8CC35 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SynpoQ8CC35 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynpoQ8CC35 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynpoQ8CC35 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SynpoQ8CC35 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SynpoQ8CC35 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SynpoQ8CC35 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SynpoQ8CC35 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SynpoQ8CC35 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SynpoQ8CC35 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SynpoQ8CC35 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SynpoQ8CC35 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynpoQ8CC35 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynpoQ8CC35 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynpoQ8CC35 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynpoQ8CC35 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynpoQ8CC35 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynpoQ8CC35 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynpoQ8CC35 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynpoQ8CC35 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SynpoQ8CC35 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynpoQ8CC35 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SynpoQ8CC35 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SynpoQ8CC35 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SynpoQ8CC35 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynpoQ8CC35 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SynpoQ8CC35 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SynpoQ8CC35 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SynpoQ8CC35 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SynpoQ8CC35 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SynpoQ8CC35 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SynpoQ8CC35 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SynpoQ8CC35 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SynpoQ8CC35 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynpoQ8CC35 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms