Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubqln3Q8C5U9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubqln3Q8C5U9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ubqln3Q8C5U9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubqln3Q8C5U9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubqln3Q8C5U9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubqln3Q8C5U9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubqln3Q8C5U9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubqln3Q8C5U9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubqln3Q8C5U9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubqln3Q8C5U9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubqln3Q8C5U9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubqln3Q8C5U9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubqln3Q8C5U9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubqln3Q8C5U9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubqln3Q8C5U9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubqln3Q8C5U9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubqln3Q8C5U9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubqln3Q8C5U9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubqln3Q8C5U9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubqln3Q8C5U9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubqln3Q8C5U9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubqln3Q8C5U9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubqln3Q8C5U9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubqln3Q8C5U9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubqln3Q8C5U9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubqln3Q8C5U9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubqln3Q8C5U9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubqln3Q8C5U9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubqln3Q8C5U9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubqln3Q8C5U9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubqln3Q8C5U9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubqln3Q8C5U9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubqln3Q8C5U9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubqln3Q8C5U9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubqln3Q8C5U9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubqln3Q8C5U9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubqln3Q8C5U9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubqln3Q8C5U9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubqln3Q8C5U9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubqln3Q8C5U9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubqln3Q8C5U9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubqln3Q8C5U9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubqln3Q8C5U9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubqln3Q8C5U9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubqln3Q8C5U9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubqln3Q8C5U9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubqln3Q8C5U9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubqln3Q8C5U9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubqln3Q8C5U9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubqln3Q8C5U9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubqln3Q8C5U9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubqln3Q8C5U9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubqln3Q8C5U9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubqln3Q8C5U9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubqln3Q8C5U9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubqln3Q8C5U9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubqln3Q8C5U9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubqln3Q8C5U9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubqln3Q8C5U9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubqln3Q8C5U9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubqln3Q8C5U9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubqln3Q8C5U9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubqln3Q8C5U9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubqln3Q8C5U9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubqln3Q8C5U9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubqln3Q8C5U9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubqln3Q8C5U9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubqln3Q8C5U9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubqln3Q8C5U9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubqln3Q8C5U9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubqln3Q8C5U9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubqln3Q8C5U9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubqln3Q8C5U9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubqln3Q8C5U9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubqln3Q8C5U9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubqln3Q8C5U9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubqln3Q8C5U9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubqln3Q8C5U9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubqln3Q8C5U9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubqln3Q8C5U9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubqln3Q8C5U9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubqln3Q8C5U9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubqln3Q8C5U9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubqln3Q8C5U9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ubqln3Q8C5U9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubqln3Q8C5U9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubqln3Q8C5U9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubqln3Q8C5U9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubqln3Q8C5U9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubqln3Q8C5U9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubqln3Q8C5U9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubqln3Q8C5U9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubqln3Q8C5U9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubqln3Q8C5U9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubqln3Q8C5U9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubqln3Q8C5U9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms