Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,43■■■□□ 2,94
Lmod1Q8BVA4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Lmod1Q8BVA4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Lmod1Q8BVA4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,35■■■□□ 2,93
Lmod1Q8BVA4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Lmod1Q8BVA4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Lmod1Q8BVA4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Lmod1Q8BVA4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,32■■■□□ 2,92
Lmod1Q8BVA4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Lmod1Q8BVA4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,28■■■□□ 2,92
Lmod1Q8BVA4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,28■■■□□ 2,92
Lmod1Q8BVA4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Lmod1Q8BVA4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,24■■■□□ 2,91
Lmod1Q8BVA4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Lmod1Q8BVA4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Lmod1Q8BVA4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Lmod1Q8BVA4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Lmod1Q8BVA4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Lmod1Q8BVA4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Lmod1Q8BVA4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Lmod1Q8BVA4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Lmod1Q8BVA4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Lmod1Q8BVA4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,03■■■□□ 2,88
Lmod1Q8BVA4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2,87
Lmod1Q8BVA4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Lmod1Q8BVA4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32,96■■■□□ 2,87
Lmod1Q8BVA4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Lmod1Q8BVA4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Lmod1Q8BVA4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Lmod1Q8BVA4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Lmod1Q8BVA4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Lmod1Q8BVA4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Lmod1Q8BVA4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32,76■■■□□ 2,83
Lmod1Q8BVA4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Lmod1Q8BVA4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Lmod1Q8BVA4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,68■■■□□ 2,82
Lmod1Q8BVA4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Lmod1Q8BVA4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Lmod1Q8BVA4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Lmod1Q8BVA4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Lmod1Q8BVA4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32,54■■■□□ 2,8
Lmod1Q8BVA4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Lmod1Q8BVA4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Lmod1Q8BVA4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Lmod1Q8BVA4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Lmod1Q8BVA4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Lmod1Q8BVA4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32,49■■■□□ 2,79
Lmod1Q8BVA4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Lmod1Q8BVA4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32,48■■■□□ 2,79
Lmod1Q8BVA4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Lmod1Q8BVA4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,78
Lmod1Q8BVA4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32,4■■■□□ 2,78
Lmod1Q8BVA4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Lmod1Q8BVA4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32,26■■■□□ 2,75
Lmod1Q8BVA4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Lmod1Q8BVA4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Lmod1Q8BVA4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Lmod1Q8BVA4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Lmod1Q8BVA4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32,2■■■□□ 2,75
Lmod1Q8BVA4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32,19■■■□□ 2,74
Lmod1Q8BVA4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Lmod1Q8BVA4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Lmod1Q8BVA4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Lmod1Q8BVA4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Lmod1Q8BVA4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Lmod1Q8BVA4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32,11■■■□□ 2,73
Lmod1Q8BVA4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Lmod1Q8BVA4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Lmod1Q8BVA4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Lmod1Q8BVA4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Lmod1Q8BVA4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2,71
Lmod1Q8BVA4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Lmod1Q8BVA4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Lmod1Q8BVA4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
Lmod1Q8BVA4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Lmod1Q8BVA4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Lmod1Q8BVA4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Lmod1Q8BVA4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31,88■■■□□ 2,69
Lmod1Q8BVA4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Lmod1Q8BVA4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Lmod1Q8BVA4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Lmod1Q8BVA4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Lmod1Q8BVA4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Lmod1Q8BVA4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31,74■■■□□ 2,67
Lmod1Q8BVA4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Lmod1Q8BVA4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,73■■■□□ 2,67
Lmod1Q8BVA4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Lmod1Q8BVA4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Lmod1Q8BVA4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Lmod1Q8BVA4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Lmod1Q8BVA4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Lmod1Q8BVA4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Lmod1Q8BVA4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Lmod1Q8BVA4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Lmod1Q8BVA4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Lmod1Q8BVA4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Lmod1Q8BVA4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Lmod1Q8BVA4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Lmod1Q8BVA4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms