Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNW9

Kbtbd11, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kbtbd11Q8BNW9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kbtbd11Q8BNW9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kbtbd11Q8BNW9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kbtbd11Q8BNW9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kbtbd11Q8BNW9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Kbtbd11Q8BNW9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kbtbd11Q8BNW9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kbtbd11Q8BNW9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kbtbd11Q8BNW9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kbtbd11Q8BNW9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kbtbd11Q8BNW9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kbtbd11Q8BNW9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kbtbd11Q8BNW9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kbtbd11Q8BNW9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kbtbd11Q8BNW9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kbtbd11Q8BNW9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kbtbd11Q8BNW9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Kbtbd11Q8BNW9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kbtbd11Q8BNW9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kbtbd11Q8BNW9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kbtbd11Q8BNW9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kbtbd11Q8BNW9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kbtbd11Q8BNW9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kbtbd11Q8BNW9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kbtbd11Q8BNW9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kbtbd11Q8BNW9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kbtbd11Q8BNW9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Kbtbd11Q8BNW9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kbtbd11Q8BNW9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kbtbd11Q8BNW9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kbtbd11Q8BNW9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kbtbd11Q8BNW9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kbtbd11Q8BNW9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kbtbd11Q8BNW9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kbtbd11Q8BNW9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kbtbd11Q8BNW9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kbtbd11Q8BNW9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kbtbd11Q8BNW9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kbtbd11Q8BNW9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kbtbd11Q8BNW9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kbtbd11Q8BNW9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kbtbd11Q8BNW9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kbtbd11Q8BNW9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kbtbd11Q8BNW9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kbtbd11Q8BNW9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kbtbd11Q8BNW9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kbtbd11Q8BNW9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kbtbd11Q8BNW9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kbtbd11Q8BNW9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kbtbd11Q8BNW9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kbtbd11Q8BNW9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kbtbd11Q8BNW9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kbtbd11Q8BNW9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kbtbd11Q8BNW9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kbtbd11Q8BNW9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kbtbd11Q8BNW9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kbtbd11Q8BNW9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kbtbd11Q8BNW9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kbtbd11Q8BNW9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kbtbd11Q8BNW9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kbtbd11Q8BNW9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kbtbd11Q8BNW9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kbtbd11Q8BNW9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Kbtbd11Q8BNW9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kbtbd11Q8BNW9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kbtbd11Q8BNW9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kbtbd11Q8BNW9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kbtbd11Q8BNW9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Kbtbd11Q8BNW9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kbtbd11Q8BNW9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kbtbd11Q8BNW9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kbtbd11Q8BNW9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kbtbd11Q8BNW9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kbtbd11Q8BNW9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kbtbd11Q8BNW9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kbtbd11Q8BNW9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kbtbd11Q8BNW9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kbtbd11Q8BNW9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kbtbd11Q8BNW9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kbtbd11Q8BNW9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kbtbd11Q8BNW9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kbtbd11Q8BNW9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kbtbd11Q8BNW9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kbtbd11Q8BNW9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kbtbd11Q8BNW9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kbtbd11Q8BNW9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kbtbd11Q8BNW9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kbtbd11Q8BNW9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kbtbd11Q8BNW9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kbtbd11Q8BNW9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kbtbd11Q8BNW9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kbtbd11Q8BNW9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kbtbd11Q8BNW9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kbtbd11Q8BNW9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kbtbd11Q8BNW9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kbtbd11Q8BNW9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kbtbd11Q8BNW9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kbtbd11Q8BNW9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kbtbd11Q8BNW9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kbtbd11Q8BNW9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms