Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rab3gap2Q8BMG7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rab3gap2Q8BMG7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Rab3gap2Q8BMG7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Rab3gap2Q8BMG7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Rab3gap2Q8BMG7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Rab3gap2Q8BMG7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Rab3gap2Q8BMG7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rab3gap2Q8BMG7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rab3gap2Q8BMG7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rab3gap2Q8BMG7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rab3gap2Q8BMG7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rab3gap2Q8BMG7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Rab3gap2Q8BMG7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Rab3gap2Q8BMG7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Rab3gap2Q8BMG7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Rab3gap2Q8BMG7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rab3gap2Q8BMG7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rab3gap2Q8BMG7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Rab3gap2Q8BMG7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rab3gap2Q8BMG7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rab3gap2Q8BMG7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rab3gap2Q8BMG7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rab3gap2Q8BMG7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rab3gap2Q8BMG7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rab3gap2Q8BMG7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Rab3gap2Q8BMG7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Rab3gap2Q8BMG7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rab3gap2Q8BMG7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rab3gap2Q8BMG7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rab3gap2Q8BMG7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rab3gap2Q8BMG7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rab3gap2Q8BMG7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rab3gap2Q8BMG7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rab3gap2Q8BMG7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rab3gap2Q8BMG7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Rab3gap2Q8BMG7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Rab3gap2Q8BMG7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Rab3gap2Q8BMG7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rab3gap2Q8BMG7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rab3gap2Q8BMG7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rab3gap2Q8BMG7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rab3gap2Q8BMG7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rab3gap2Q8BMG7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rab3gap2Q8BMG7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rab3gap2Q8BMG7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rab3gap2Q8BMG7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rab3gap2Q8BMG7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rab3gap2Q8BMG7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rab3gap2Q8BMG7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rab3gap2Q8BMG7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rab3gap2Q8BMG7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Rab3gap2Q8BMG7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Rab3gap2Q8BMG7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
Rab3gap2Q8BMG7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Rab3gap2Q8BMG7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Rab3gap2Q8BMG7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rab3gap2Q8BMG7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rab3gap2Q8BMG7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rab3gap2Q8BMG7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rab3gap2Q8BMG7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rab3gap2Q8BMG7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rab3gap2Q8BMG7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rab3gap2Q8BMG7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rab3gap2Q8BMG7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rab3gap2Q8BMG7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rab3gap2Q8BMG7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rab3gap2Q8BMG7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rab3gap2Q8BMG7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rab3gap2Q8BMG7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rab3gap2Q8BMG7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rab3gap2Q8BMG7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rab3gap2Q8BMG7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rab3gap2Q8BMG7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rab3gap2Q8BMG7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Rab3gap2Q8BMG7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rab3gap2Q8BMG7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rab3gap2Q8BMG7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rab3gap2Q8BMG7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rab3gap2Q8BMG7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rab3gap2Q8BMG7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Rab3gap2Q8BMG7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rab3gap2Q8BMG7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rab3gap2Q8BMG7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rab3gap2Q8BMG7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rab3gap2Q8BMG7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rab3gap2Q8BMG7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rab3gap2Q8BMG7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rab3gap2Q8BMG7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rab3gap2Q8BMG7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rab3gap2Q8BMG7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rab3gap2Q8BMG7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rab3gap2Q8BMG7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rab3gap2Q8BMG7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Rab3gap2Q8BMG7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rab3gap2Q8BMG7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms