Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI79

Ccdc40, Coiled-coil domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc40Q8BI79 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Ccdc40Q8BI79 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ccdc40Q8BI79 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,31■■■□□ 2,12
Ccdc40Q8BI79 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Ccdc40Q8BI79 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ccdc40Q8BI79 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Ccdc40Q8BI79 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ccdc40Q8BI79 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Ccdc40Q8BI79 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ccdc40Q8BI79 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ccdc40Q8BI79 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ccdc40Q8BI79 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Ccdc40Q8BI79 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ccdc40Q8BI79 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Ccdc40Q8BI79 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Ccdc40Q8BI79 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Ccdc40Q8BI79 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ccdc40Q8BI79 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ccdc40Q8BI79 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Ccdc40Q8BI79 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ccdc40Q8BI79 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ccdc40Q8BI79 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ccdc40Q8BI79 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ccdc40Q8BI79 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ccdc40Q8BI79 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ccdc40Q8BI79 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ccdc40Q8BI79 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Ccdc40Q8BI79 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ccdc40Q8BI79 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ccdc40Q8BI79 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ccdc40Q8BI79 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ccdc40Q8BI79 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ccdc40Q8BI79 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ccdc40Q8BI79 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ccdc40Q8BI79 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ccdc40Q8BI79 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
Ccdc40Q8BI79 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ccdc40Q8BI79 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,77■■■□□ 2,04
Ccdc40Q8BI79 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Ccdc40Q8BI79 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Ccdc40Q8BI79 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ccdc40Q8BI79 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ccdc40Q8BI79 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ccdc40Q8BI79 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Ccdc40Q8BI79 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ccdc40Q8BI79 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
Ccdc40Q8BI79 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ccdc40Q8BI79 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ccdc40Q8BI79 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ccdc40Q8BI79 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ccdc40Q8BI79 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,52■■■□□ 2
Ccdc40Q8BI79 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ccdc40Q8BI79 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ccdc40Q8BI79 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ccdc40Q8BI79 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Ccdc40Q8BI79 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ccdc40Q8BI79 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Ccdc40Q8BI79 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Ccdc40Q8BI79 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Ccdc40Q8BI79 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Ccdc40Q8BI79 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ccdc40Q8BI79 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ccdc40Q8BI79 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ccdc40Q8BI79 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Ccdc40Q8BI79 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Ccdc40Q8BI79 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,31■■□□□ 1,96
Ccdc40Q8BI79 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Ccdc40Q8BI79 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ccdc40Q8BI79 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ccdc40Q8BI79 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ccdc40Q8BI79 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ccdc40Q8BI79 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Ccdc40Q8BI79 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Ccdc40Q8BI79 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Ccdc40Q8BI79 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Ccdc40Q8BI79 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Ccdc40Q8BI79 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Ccdc40Q8BI79 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Ccdc40Q8BI79 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Ccdc40Q8BI79 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Ccdc40Q8BI79 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Ccdc40Q8BI79 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Ccdc40Q8BI79 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Ccdc40Q8BI79 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,08■■□□□ 1,93
Ccdc40Q8BI79 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Ccdc40Q8BI79 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Ccdc40Q8BI79 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Ccdc40Q8BI79 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Ccdc40Q8BI79 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Ccdc40Q8BI79 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ccdc40Q8BI79 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ccdc40Q8BI79 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Ccdc40Q8BI79 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc40Q8BI79 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc40Q8BI79 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc40Q8BI79 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc40Q8BI79 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Ccdc40Q8BI79 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ccdc40Q8BI79 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,96■■□□□ 1,91
Ccdc40Q8BI79 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,2 ms