Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH74

Nup107, Nuclear pore complex protein Nup107, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup107Q8BH74 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup107Q8BH74 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nup107Q8BH74 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup107Q8BH74 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nup107Q8BH74 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup107Q8BH74 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup107Q8BH74 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup107Q8BH74 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup107Q8BH74 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup107Q8BH74 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup107Q8BH74 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup107Q8BH74 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup107Q8BH74 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup107Q8BH74 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup107Q8BH74 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup107Q8BH74 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup107Q8BH74 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup107Q8BH74 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup107Q8BH74 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup107Q8BH74 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup107Q8BH74 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup107Q8BH74 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup107Q8BH74 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup107Q8BH74 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup107Q8BH74 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup107Q8BH74 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup107Q8BH74 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nup107Q8BH74 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup107Q8BH74 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup107Q8BH74 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup107Q8BH74 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup107Q8BH74 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup107Q8BH74 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup107Q8BH74 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup107Q8BH74 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nup107Q8BH74 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup107Q8BH74 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup107Q8BH74 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup107Q8BH74 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup107Q8BH74 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup107Q8BH74 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup107Q8BH74 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup107Q8BH74 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nup107Q8BH74 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup107Q8BH74 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup107Q8BH74 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup107Q8BH74 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup107Q8BH74 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup107Q8BH74 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup107Q8BH74 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup107Q8BH74 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup107Q8BH74 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup107Q8BH74 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup107Q8BH74 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup107Q8BH74 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup107Q8BH74 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup107Q8BH74 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup107Q8BH74 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup107Q8BH74 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup107Q8BH74 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup107Q8BH74 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup107Q8BH74 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup107Q8BH74 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup107Q8BH74 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup107Q8BH74 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup107Q8BH74 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup107Q8BH74 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup107Q8BH74 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup107Q8BH74 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup107Q8BH74 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup107Q8BH74 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup107Q8BH74 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup107Q8BH74 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup107Q8BH74 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup107Q8BH74 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup107Q8BH74 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup107Q8BH74 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup107Q8BH74 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup107Q8BH74 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup107Q8BH74 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup107Q8BH74 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup107Q8BH74 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup107Q8BH74 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup107Q8BH74 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup107Q8BH74 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup107Q8BH74 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup107Q8BH74 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup107Q8BH74 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup107Q8BH74 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup107Q8BH74 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup107Q8BH74 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup107Q8BH74 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup107Q8BH74 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup107Q8BH74 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup107Q8BH74 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup107Q8BH74 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup107Q8BH74 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup107Q8BH74 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup107Q8BH74 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup107Q8BH74 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms