Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA5

Krr1, KRR1 small subunit processome component homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krr1Q8BGA5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krr1Q8BGA5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krr1Q8BGA5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krr1Q8BGA5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krr1Q8BGA5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krr1Q8BGA5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krr1Q8BGA5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krr1Q8BGA5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krr1Q8BGA5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krr1Q8BGA5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krr1Q8BGA5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krr1Q8BGA5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krr1Q8BGA5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krr1Q8BGA5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krr1Q8BGA5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krr1Q8BGA5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krr1Q8BGA5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krr1Q8BGA5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krr1Q8BGA5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krr1Q8BGA5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krr1Q8BGA5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krr1Q8BGA5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krr1Q8BGA5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krr1Q8BGA5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krr1Q8BGA5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krr1Q8BGA5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krr1Q8BGA5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krr1Q8BGA5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krr1Q8BGA5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krr1Q8BGA5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krr1Q8BGA5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Krr1Q8BGA5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krr1Q8BGA5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krr1Q8BGA5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krr1Q8BGA5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krr1Q8BGA5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krr1Q8BGA5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krr1Q8BGA5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Krr1Q8BGA5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krr1Q8BGA5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krr1Q8BGA5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Krr1Q8BGA5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krr1Q8BGA5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krr1Q8BGA5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krr1Q8BGA5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krr1Q8BGA5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krr1Q8BGA5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krr1Q8BGA5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krr1Q8BGA5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krr1Q8BGA5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krr1Q8BGA5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krr1Q8BGA5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krr1Q8BGA5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Krr1Q8BGA5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krr1Q8BGA5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Krr1Q8BGA5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krr1Q8BGA5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krr1Q8BGA5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krr1Q8BGA5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krr1Q8BGA5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krr1Q8BGA5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krr1Q8BGA5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krr1Q8BGA5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krr1Q8BGA5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krr1Q8BGA5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krr1Q8BGA5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krr1Q8BGA5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krr1Q8BGA5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krr1Q8BGA5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krr1Q8BGA5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krr1Q8BGA5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krr1Q8BGA5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krr1Q8BGA5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Krr1Q8BGA5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krr1Q8BGA5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krr1Q8BGA5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Krr1Q8BGA5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krr1Q8BGA5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krr1Q8BGA5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krr1Q8BGA5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krr1Q8BGA5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krr1Q8BGA5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krr1Q8BGA5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krr1Q8BGA5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krr1Q8BGA5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krr1Q8BGA5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krr1Q8BGA5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krr1Q8BGA5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krr1Q8BGA5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krr1Q8BGA5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krr1Q8BGA5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krr1Q8BGA5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krr1Q8BGA5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krr1Q8BGA5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krr1Q8BGA5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krr1Q8BGA5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krr1Q8BGA5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krr1Q8BGA5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krr1Q8BGA5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Krr1Q8BGA5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms