Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Katnb1Q8BG40 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Katnb1Q8BG40 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Katnb1Q8BG40 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Katnb1Q8BG40 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Katnb1Q8BG40 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Katnb1Q8BG40 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Katnb1Q8BG40 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Katnb1Q8BG40 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Katnb1Q8BG40 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Katnb1Q8BG40 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Katnb1Q8BG40 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Katnb1Q8BG40 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Katnb1Q8BG40 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Katnb1Q8BG40 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Katnb1Q8BG40 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Katnb1Q8BG40 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Katnb1Q8BG40 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Katnb1Q8BG40 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Katnb1Q8BG40 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Katnb1Q8BG40 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Katnb1Q8BG40 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Katnb1Q8BG40 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Katnb1Q8BG40 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Katnb1Q8BG40 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Katnb1Q8BG40 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Katnb1Q8BG40 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Katnb1Q8BG40 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Katnb1Q8BG40 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Katnb1Q8BG40 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Katnb1Q8BG40 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Katnb1Q8BG40 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Katnb1Q8BG40 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Katnb1Q8BG40 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Katnb1Q8BG40 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Katnb1Q8BG40 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Katnb1Q8BG40 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Katnb1Q8BG40 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Katnb1Q8BG40 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Katnb1Q8BG40 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Katnb1Q8BG40 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Katnb1Q8BG40 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Katnb1Q8BG40 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Katnb1Q8BG40 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Katnb1Q8BG40 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Katnb1Q8BG40 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Katnb1Q8BG40 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Katnb1Q8BG40 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Katnb1Q8BG40 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Katnb1Q8BG40 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Katnb1Q8BG40 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Katnb1Q8BG40 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Katnb1Q8BG40 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Katnb1Q8BG40 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Katnb1Q8BG40 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Katnb1Q8BG40 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Katnb1Q8BG40 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Katnb1Q8BG40 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Katnb1Q8BG40 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Katnb1Q8BG40 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Katnb1Q8BG40 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Katnb1Q8BG40 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Katnb1Q8BG40 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Katnb1Q8BG40 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Katnb1Q8BG40 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Katnb1Q8BG40 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Katnb1Q8BG40 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Katnb1Q8BG40 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Katnb1Q8BG40 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Katnb1Q8BG40 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Katnb1Q8BG40 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Katnb1Q8BG40 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Katnb1Q8BG40 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Katnb1Q8BG40 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Katnb1Q8BG40 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Katnb1Q8BG40 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Katnb1Q8BG40 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Katnb1Q8BG40 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Katnb1Q8BG40 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Katnb1Q8BG40 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Katnb1Q8BG40 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Katnb1Q8BG40 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Katnb1Q8BG40 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Katnb1Q8BG40 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Katnb1Q8BG40 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Katnb1Q8BG40 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Katnb1Q8BG40 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Katnb1Q8BG40 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Katnb1Q8BG40 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Katnb1Q8BG40 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Katnb1Q8BG40 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Katnb1Q8BG40 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Katnb1Q8BG40 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Katnb1Q8BG40 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Katnb1Q8BG40 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Katnb1Q8BG40 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Katnb1Q8BG40 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Katnb1Q8BG40 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Katnb1Q8BG40 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Katnb1Q8BG40 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms