Protein–RNA interactions for Protein: Q812F8

Mgat4b, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat4bQ812F8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mgat4bQ812F8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mgat4bQ812F8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mgat4bQ812F8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mgat4bQ812F8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mgat4bQ812F8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mgat4bQ812F8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mgat4bQ812F8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Mgat4bQ812F8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mgat4bQ812F8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mgat4bQ812F8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mgat4bQ812F8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mgat4bQ812F8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mgat4bQ812F8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mgat4bQ812F8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mgat4bQ812F8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mgat4bQ812F8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mgat4bQ812F8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mgat4bQ812F8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mgat4bQ812F8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mgat4bQ812F8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mgat4bQ812F8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mgat4bQ812F8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mgat4bQ812F8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mgat4bQ812F8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mgat4bQ812F8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mgat4bQ812F8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Mgat4bQ812F8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mgat4bQ812F8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mgat4bQ812F8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mgat4bQ812F8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mgat4bQ812F8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mgat4bQ812F8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mgat4bQ812F8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mgat4bQ812F8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mgat4bQ812F8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mgat4bQ812F8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mgat4bQ812F8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mgat4bQ812F8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mgat4bQ812F8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mgat4bQ812F8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mgat4bQ812F8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mgat4bQ812F8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mgat4bQ812F8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mgat4bQ812F8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mgat4bQ812F8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mgat4bQ812F8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mgat4bQ812F8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mgat4bQ812F8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mgat4bQ812F8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mgat4bQ812F8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Mgat4bQ812F8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mgat4bQ812F8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mgat4bQ812F8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mgat4bQ812F8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mgat4bQ812F8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mgat4bQ812F8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Mgat4bQ812F8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mgat4bQ812F8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Mgat4bQ812F8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mgat4bQ812F8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mgat4bQ812F8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mgat4bQ812F8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mgat4bQ812F8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mgat4bQ812F8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mgat4bQ812F8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mgat4bQ812F8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mgat4bQ812F8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mgat4bQ812F8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mgat4bQ812F8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mgat4bQ812F8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mgat4bQ812F8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mgat4bQ812F8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mgat4bQ812F8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mgat4bQ812F8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mgat4bQ812F8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mgat4bQ812F8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mgat4bQ812F8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mgat4bQ812F8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mgat4bQ812F8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mgat4bQ812F8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mgat4bQ812F8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mgat4bQ812F8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mgat4bQ812F8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Mgat4bQ812F8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mgat4bQ812F8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mgat4bQ812F8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mgat4bQ812F8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mgat4bQ812F8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mgat4bQ812F8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mgat4bQ812F8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mgat4bQ812F8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mgat4bQ812F8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mgat4bQ812F8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mgat4bQ812F8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mgat4bQ812F8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mgat4bQ812F8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mgat4bQ812F8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mgat4bQ812F8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mgat4bQ812F8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms