Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NanogQ80Z64 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NanogQ80Z64 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NanogQ80Z64 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NanogQ80Z64 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NanogQ80Z64 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NanogQ80Z64 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NanogQ80Z64 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NanogQ80Z64 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NanogQ80Z64 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NanogQ80Z64 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NanogQ80Z64 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NanogQ80Z64 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NanogQ80Z64 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NanogQ80Z64 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NanogQ80Z64 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NanogQ80Z64 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NanogQ80Z64 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NanogQ80Z64 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NanogQ80Z64 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NanogQ80Z64 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NanogQ80Z64 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NanogQ80Z64 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NanogQ80Z64 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NanogQ80Z64 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NanogQ80Z64 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NanogQ80Z64 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NanogQ80Z64 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NanogQ80Z64 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NanogQ80Z64 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NanogQ80Z64 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NanogQ80Z64 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NanogQ80Z64 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NanogQ80Z64 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NanogQ80Z64 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NanogQ80Z64 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NanogQ80Z64 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NanogQ80Z64 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NanogQ80Z64 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NanogQ80Z64 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NanogQ80Z64 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NanogQ80Z64 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NanogQ80Z64 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NanogQ80Z64 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NanogQ80Z64 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NanogQ80Z64 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NanogQ80Z64 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NanogQ80Z64 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NanogQ80Z64 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NanogQ80Z64 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NanogQ80Z64 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NanogQ80Z64 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NanogQ80Z64 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NanogQ80Z64 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NanogQ80Z64 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NanogQ80Z64 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NanogQ80Z64 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NanogQ80Z64 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NanogQ80Z64 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NanogQ80Z64 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NanogQ80Z64 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NanogQ80Z64 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NanogQ80Z64 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NanogQ80Z64 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NanogQ80Z64 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NanogQ80Z64 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NanogQ80Z64 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NanogQ80Z64 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NanogQ80Z64 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NanogQ80Z64 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NanogQ80Z64 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NanogQ80Z64 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NanogQ80Z64 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NanogQ80Z64 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NanogQ80Z64 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NanogQ80Z64 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NanogQ80Z64 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NanogQ80Z64 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NanogQ80Z64 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NanogQ80Z64 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NanogQ80Z64 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NanogQ80Z64 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NanogQ80Z64 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NanogQ80Z64 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NanogQ80Z64 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NanogQ80Z64 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NanogQ80Z64 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NanogQ80Z64 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NanogQ80Z64 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NanogQ80Z64 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NanogQ80Z64 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NanogQ80Z64 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NanogQ80Z64 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NanogQ80Z64 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NanogQ80Z64 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NanogQ80Z64 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NanogQ80Z64 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NanogQ80Z64 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NanogQ80Z64 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NanogQ80Z64 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
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