Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmQ7TSN2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmQ7TSN2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmQ7TSN2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClmQ7TSN2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ClmQ7TSN2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ClmQ7TSN2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClmQ7TSN2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ClmQ7TSN2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ClmQ7TSN2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ClmQ7TSN2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ClmQ7TSN2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ClmQ7TSN2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ClmQ7TSN2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ClmQ7TSN2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ClmQ7TSN2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ClmQ7TSN2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ClmQ7TSN2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClmQ7TSN2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ClmQ7TSN2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ClmQ7TSN2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClmQ7TSN2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClmQ7TSN2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClmQ7TSN2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClmQ7TSN2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ClmQ7TSN2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ClmQ7TSN2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ClmQ7TSN2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClmQ7TSN2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClmQ7TSN2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClmQ7TSN2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ClmQ7TSN2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClmQ7TSN2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClmQ7TSN2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClmQ7TSN2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClmQ7TSN2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClmQ7TSN2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClmQ7TSN2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClmQ7TSN2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClmQ7TSN2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClmQ7TSN2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClmQ7TSN2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClmQ7TSN2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClmQ7TSN2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ClmQ7TSN2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClmQ7TSN2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClmQ7TSN2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClmQ7TSN2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClmQ7TSN2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClmQ7TSN2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClmQ7TSN2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClmQ7TSN2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClmQ7TSN2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClmQ7TSN2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClmQ7TSN2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClmQ7TSN2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ClmQ7TSN2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClmQ7TSN2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClmQ7TSN2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClmQ7TSN2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClmQ7TSN2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClmQ7TSN2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClmQ7TSN2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClmQ7TSN2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ClmQ7TSN2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ClmQ7TSN2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClmQ7TSN2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClmQ7TSN2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClmQ7TSN2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClmQ7TSN2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ClmQ7TSN2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ClmQ7TSN2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClmQ7TSN2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClmQ7TSN2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClmQ7TSN2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClmQ7TSN2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClmQ7TSN2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClmQ7TSN2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClmQ7TSN2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClmQ7TSN2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ClmQ7TSN2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClmQ7TSN2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClmQ7TSN2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClmQ7TSN2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ClmQ7TSN2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ClmQ7TSN2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ClmQ7TSN2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ClmQ7TSN2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ClmQ7TSN2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ClmQ7TSN2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClmQ7TSN2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClmQ7TSN2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClmQ7TSN2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmQ7TSN2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClmQ7TSN2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClmQ7TSN2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClmQ7TSN2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClmQ7TSN2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClmQ7TSN2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ClmQ7TSN2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms