Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMF3

Ndufa12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa12Q7TMF3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufa12Q7TMF3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufa12Q7TMF3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufa12Q7TMF3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufa12Q7TMF3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufa12Q7TMF3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufa12Q7TMF3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufa12Q7TMF3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufa12Q7TMF3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufa12Q7TMF3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufa12Q7TMF3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufa12Q7TMF3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufa12Q7TMF3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa12Q7TMF3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufa12Q7TMF3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa12Q7TMF3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufa12Q7TMF3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufa12Q7TMF3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufa12Q7TMF3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufa12Q7TMF3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufa12Q7TMF3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufa12Q7TMF3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa12Q7TMF3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufa12Q7TMF3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufa12Q7TMF3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufa12Q7TMF3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufa12Q7TMF3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufa12Q7TMF3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufa12Q7TMF3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufa12Q7TMF3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufa12Q7TMF3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufa12Q7TMF3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufa12Q7TMF3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa12Q7TMF3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa12Q7TMF3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufa12Q7TMF3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa12Q7TMF3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa12Q7TMF3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa12Q7TMF3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa12Q7TMF3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufa12Q7TMF3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa12Q7TMF3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa12Q7TMF3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufa12Q7TMF3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa12Q7TMF3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa12Q7TMF3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa12Q7TMF3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa12Q7TMF3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufa12Q7TMF3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufa12Q7TMF3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufa12Q7TMF3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufa12Q7TMF3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufa12Q7TMF3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa12Q7TMF3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufa12Q7TMF3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufa12Q7TMF3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufa12Q7TMF3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufa12Q7TMF3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufa12Q7TMF3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufa12Q7TMF3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufa12Q7TMF3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufa12Q7TMF3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufa12Q7TMF3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufa12Q7TMF3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufa12Q7TMF3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufa12Q7TMF3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufa12Q7TMF3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ndufa12Q7TMF3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufa12Q7TMF3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufa12Q7TMF3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufa12Q7TMF3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufa12Q7TMF3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufa12Q7TMF3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufa12Q7TMF3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufa12Q7TMF3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufa12Q7TMF3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufa12Q7TMF3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufa12Q7TMF3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ndufa12Q7TMF3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufa12Q7TMF3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufa12Q7TMF3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufa12Q7TMF3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufa12Q7TMF3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufa12Q7TMF3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufa12Q7TMF3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufa12Q7TMF3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufa12Q7TMF3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ndufa12Q7TMF3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufa12Q7TMF3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufa12Q7TMF3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufa12Q7TMF3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufa12Q7TMF3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufa12Q7TMF3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufa12Q7TMF3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufa12Q7TMF3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufa12Q7TMF3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufa12Q7TMF3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufa12Q7TMF3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufa12Q7TMF3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufa12Q7TMF3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms