Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spcs3Q6ZWQ7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Spcs3Q6ZWQ7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spcs3Q6ZWQ7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spcs3Q6ZWQ7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spcs3Q6ZWQ7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spcs3Q6ZWQ7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spcs3Q6ZWQ7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spcs3Q6ZWQ7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spcs3Q6ZWQ7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spcs3Q6ZWQ7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spcs3Q6ZWQ7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spcs3Q6ZWQ7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spcs3Q6ZWQ7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spcs3Q6ZWQ7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spcs3Q6ZWQ7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spcs3Q6ZWQ7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spcs3Q6ZWQ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spcs3Q6ZWQ7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spcs3Q6ZWQ7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spcs3Q6ZWQ7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spcs3Q6ZWQ7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Spcs3Q6ZWQ7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spcs3Q6ZWQ7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Spcs3Q6ZWQ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spcs3Q6ZWQ7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Spcs3Q6ZWQ7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spcs3Q6ZWQ7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spcs3Q6ZWQ7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spcs3Q6ZWQ7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spcs3Q6ZWQ7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spcs3Q6ZWQ7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spcs3Q6ZWQ7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spcs3Q6ZWQ7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spcs3Q6ZWQ7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spcs3Q6ZWQ7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spcs3Q6ZWQ7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spcs3Q6ZWQ7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spcs3Q6ZWQ7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spcs3Q6ZWQ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spcs3Q6ZWQ7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spcs3Q6ZWQ7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spcs3Q6ZWQ7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Spcs3Q6ZWQ7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spcs3Q6ZWQ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Spcs3Q6ZWQ7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spcs3Q6ZWQ7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spcs3Q6ZWQ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spcs3Q6ZWQ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spcs3Q6ZWQ7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spcs3Q6ZWQ7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spcs3Q6ZWQ7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spcs3Q6ZWQ7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Spcs3Q6ZWQ7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spcs3Q6ZWQ7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spcs3Q6ZWQ7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spcs3Q6ZWQ7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spcs3Q6ZWQ7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spcs3Q6ZWQ7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spcs3Q6ZWQ7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spcs3Q6ZWQ7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spcs3Q6ZWQ7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spcs3Q6ZWQ7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spcs3Q6ZWQ7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spcs3Q6ZWQ7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spcs3Q6ZWQ7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spcs3Q6ZWQ7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spcs3Q6ZWQ7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Spcs3Q6ZWQ7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Spcs3Q6ZWQ7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spcs3Q6ZWQ7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spcs3Q6ZWQ7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spcs3Q6ZWQ7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Spcs3Q6ZWQ7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spcs3Q6ZWQ7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spcs3Q6ZWQ7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Spcs3Q6ZWQ7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spcs3Q6ZWQ7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spcs3Q6ZWQ7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spcs3Q6ZWQ7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spcs3Q6ZWQ7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spcs3Q6ZWQ7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spcs3Q6ZWQ7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spcs3Q6ZWQ7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spcs3Q6ZWQ7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spcs3Q6ZWQ7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spcs3Q6ZWQ7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spcs3Q6ZWQ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spcs3Q6ZWQ7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spcs3Q6ZWQ7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spcs3Q6ZWQ7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spcs3Q6ZWQ7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spcs3Q6ZWQ7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spcs3Q6ZWQ7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spcs3Q6ZWQ7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spcs3Q6ZWQ7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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