Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NinlQ6ZQ12 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NinlQ6ZQ12 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NinlQ6ZQ12 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NinlQ6ZQ12 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NinlQ6ZQ12 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NinlQ6ZQ12 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
NinlQ6ZQ12 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
NinlQ6ZQ12 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NinlQ6ZQ12 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
NinlQ6ZQ12 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NinlQ6ZQ12 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NinlQ6ZQ12 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NinlQ6ZQ12 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
NinlQ6ZQ12 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NinlQ6ZQ12 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NinlQ6ZQ12 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NinlQ6ZQ12 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
NinlQ6ZQ12 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NinlQ6ZQ12 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
NinlQ6ZQ12 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NinlQ6ZQ12 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NinlQ6ZQ12 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NinlQ6ZQ12 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
NinlQ6ZQ12 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NinlQ6ZQ12 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
NinlQ6ZQ12 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
NinlQ6ZQ12 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NinlQ6ZQ12 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NinlQ6ZQ12 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NinlQ6ZQ12 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NinlQ6ZQ12 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
NinlQ6ZQ12 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NinlQ6ZQ12 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NinlQ6ZQ12 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NinlQ6ZQ12 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NinlQ6ZQ12 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NinlQ6ZQ12 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NinlQ6ZQ12 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NinlQ6ZQ12 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NinlQ6ZQ12 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NinlQ6ZQ12 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
NinlQ6ZQ12 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NinlQ6ZQ12 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
NinlQ6ZQ12 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NinlQ6ZQ12 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NinlQ6ZQ12 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NinlQ6ZQ12 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NinlQ6ZQ12 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NinlQ6ZQ12 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NinlQ6ZQ12 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NinlQ6ZQ12 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NinlQ6ZQ12 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NinlQ6ZQ12 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NinlQ6ZQ12 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NinlQ6ZQ12 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NinlQ6ZQ12 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
NinlQ6ZQ12 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NinlQ6ZQ12 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NinlQ6ZQ12 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NinlQ6ZQ12 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NinlQ6ZQ12 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NinlQ6ZQ12 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NinlQ6ZQ12 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NinlQ6ZQ12 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NinlQ6ZQ12 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NinlQ6ZQ12 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NinlQ6ZQ12 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NinlQ6ZQ12 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
NinlQ6ZQ12 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NinlQ6ZQ12 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NinlQ6ZQ12 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
NinlQ6ZQ12 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
NinlQ6ZQ12 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NinlQ6ZQ12 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NinlQ6ZQ12 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NinlQ6ZQ12 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NinlQ6ZQ12 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NinlQ6ZQ12 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NinlQ6ZQ12 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NinlQ6ZQ12 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
NinlQ6ZQ12 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NinlQ6ZQ12 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NinlQ6ZQ12 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
NinlQ6ZQ12 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
NinlQ6ZQ12 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NinlQ6ZQ12 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NinlQ6ZQ12 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NinlQ6ZQ12 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NinlQ6ZQ12 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NinlQ6ZQ12 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NinlQ6ZQ12 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NinlQ6ZQ12 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NinlQ6ZQ12 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NinlQ6ZQ12 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NinlQ6ZQ12 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
NinlQ6ZQ12 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NinlQ6ZQ12 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
NinlQ6ZQ12 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
NinlQ6ZQ12 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
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