Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-M2Q6W9L1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2-M2Q6W9L1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2-M2Q6W9L1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2-M2Q6W9L1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
H2-M2Q6W9L1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-M2Q6W9L1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2-M2Q6W9L1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-M2Q6W9L1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-M2Q6W9L1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-M2Q6W9L1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
H2-M2Q6W9L1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2-M2Q6W9L1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2-M2Q6W9L1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-M2Q6W9L1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-M2Q6W9L1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
H2-M2Q6W9L1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
H2-M2Q6W9L1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2-M2Q6W9L1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2-M2Q6W9L1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
H2-M2Q6W9L1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
H2-M2Q6W9L1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-M2Q6W9L1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2-M2Q6W9L1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2-M2Q6W9L1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-M2Q6W9L1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2-M2Q6W9L1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-M2Q6W9L1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-M2Q6W9L1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
H2-M2Q6W9L1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2-M2Q6W9L1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-M2Q6W9L1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2-M2Q6W9L1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-M2Q6W9L1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-M2Q6W9L1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-M2Q6W9L1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-M2Q6W9L1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-M2Q6W9L1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-M2Q6W9L1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-M2Q6W9L1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-M2Q6W9L1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-M2Q6W9L1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-M2Q6W9L1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-M2Q6W9L1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-M2Q6W9L1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2-M2Q6W9L1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-M2Q6W9L1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-M2Q6W9L1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-M2Q6W9L1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-M2Q6W9L1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2-M2Q6W9L1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-M2Q6W9L1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-M2Q6W9L1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-M2Q6W9L1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-M2Q6W9L1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-M2Q6W9L1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-M2Q6W9L1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-M2Q6W9L1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2-M2Q6W9L1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
H2-M2Q6W9L1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-M2Q6W9L1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-M2Q6W9L1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-M2Q6W9L1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-M2Q6W9L1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-M2Q6W9L1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-M2Q6W9L1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-M2Q6W9L1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-M2Q6W9L1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-M2Q6W9L1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-M2Q6W9L1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-M2Q6W9L1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-M2Q6W9L1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
H2-M2Q6W9L1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-M2Q6W9L1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-M2Q6W9L1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-M2Q6W9L1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-M2Q6W9L1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-M2Q6W9L1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-M2Q6W9L1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-M2Q6W9L1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-M2Q6W9L1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-M2Q6W9L1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-M2Q6W9L1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-M2Q6W9L1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-M2Q6W9L1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-M2Q6W9L1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-M2Q6W9L1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-M2Q6W9L1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-M2Q6W9L1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-M2Q6W9L1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-M2Q6W9L1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-M2Q6W9L1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-M2Q6W9L1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-M2Q6W9L1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-M2Q6W9L1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-M2Q6W9L1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-M2Q6W9L1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-M2Q6W9L1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-M2Q6W9L1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-M2Q6W9L1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms