Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lrrn2Q6PHP6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lrrn2Q6PHP6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrrn2Q6PHP6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lrrn2Q6PHP6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lrrn2Q6PHP6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Lrrn2Q6PHP6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lrrn2Q6PHP6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lrrn2Q6PHP6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lrrn2Q6PHP6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lrrn2Q6PHP6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Lrrn2Q6PHP6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lrrn2Q6PHP6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lrrn2Q6PHP6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Lrrn2Q6PHP6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrrn2Q6PHP6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrrn2Q6PHP6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lrrn2Q6PHP6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrn2Q6PHP6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrrn2Q6PHP6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Lrrn2Q6PHP6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Lrrn2Q6PHP6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Lrrn2Q6PHP6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lrrn2Q6PHP6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lrrn2Q6PHP6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrrn2Q6PHP6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Lrrn2Q6PHP6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrrn2Q6PHP6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrrn2Q6PHP6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lrrn2Q6PHP6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrrn2Q6PHP6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrn2Q6PHP6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrrn2Q6PHP6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lrrn2Q6PHP6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrrn2Q6PHP6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrn2Q6PHP6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrrn2Q6PHP6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrn2Q6PHP6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Lrrn2Q6PHP6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrn2Q6PHP6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrn2Q6PHP6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrn2Q6PHP6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrn2Q6PHP6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrrn2Q6PHP6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrrn2Q6PHP6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrrn2Q6PHP6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrn2Q6PHP6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrrn2Q6PHP6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrrn2Q6PHP6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lrrn2Q6PHP6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrn2Q6PHP6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrn2Q6PHP6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrn2Q6PHP6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrn2Q6PHP6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrn2Q6PHP6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrn2Q6PHP6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrrn2Q6PHP6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrrn2Q6PHP6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrrn2Q6PHP6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrrn2Q6PHP6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lrrn2Q6PHP6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrn2Q6PHP6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrrn2Q6PHP6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrn2Q6PHP6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrn2Q6PHP6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrn2Q6PHP6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrrn2Q6PHP6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrrn2Q6PHP6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrn2Q6PHP6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrn2Q6PHP6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrn2Q6PHP6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrn2Q6PHP6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrrn2Q6PHP6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrrn2Q6PHP6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrrn2Q6PHP6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrn2Q6PHP6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrn2Q6PHP6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrn2Q6PHP6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrn2Q6PHP6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrn2Q6PHP6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrn2Q6PHP6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrn2Q6PHP6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrn2Q6PHP6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrrn2Q6PHP6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrrn2Q6PHP6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrrn2Q6PHP6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrrn2Q6PHP6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrrn2Q6PHP6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrrn2Q6PHP6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrn2Q6PHP6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrn2Q6PHP6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrrn2Q6PHP6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrrn2Q6PHP6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lrrn2Q6PHP6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrn2Q6PHP6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrn2Q6PHP6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrn2Q6PHP6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrn2Q6PHP6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrrn2Q6PHP6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms