Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atl2Q6PA06 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atl2Q6PA06 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atl2Q6PA06 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atl2Q6PA06 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atl2Q6PA06 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atl2Q6PA06 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atl2Q6PA06 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atl2Q6PA06 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atl2Q6PA06 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atl2Q6PA06 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Atl2Q6PA06 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Atl2Q6PA06 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atl2Q6PA06 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atl2Q6PA06 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atl2Q6PA06 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atl2Q6PA06 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atl2Q6PA06 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atl2Q6PA06 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atl2Q6PA06 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atl2Q6PA06 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atl2Q6PA06 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atl2Q6PA06 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atl2Q6PA06 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atl2Q6PA06 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atl2Q6PA06 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atl2Q6PA06 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Atl2Q6PA06 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atl2Q6PA06 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atl2Q6PA06 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Atl2Q6PA06 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atl2Q6PA06 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Atl2Q6PA06 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atl2Q6PA06 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atl2Q6PA06 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atl2Q6PA06 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Atl2Q6PA06 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atl2Q6PA06 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atl2Q6PA06 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atl2Q6PA06 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atl2Q6PA06 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atl2Q6PA06 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atl2Q6PA06 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atl2Q6PA06 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atl2Q6PA06 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atl2Q6PA06 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atl2Q6PA06 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atl2Q6PA06 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Atl2Q6PA06 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atl2Q6PA06 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atl2Q6PA06 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Atl2Q6PA06 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atl2Q6PA06 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atl2Q6PA06 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atl2Q6PA06 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atl2Q6PA06 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atl2Q6PA06 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Atl2Q6PA06 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atl2Q6PA06 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Atl2Q6PA06 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atl2Q6PA06 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atl2Q6PA06 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atl2Q6PA06 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atl2Q6PA06 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atl2Q6PA06 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atl2Q6PA06 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atl2Q6PA06 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atl2Q6PA06 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Atl2Q6PA06 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atl2Q6PA06 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atl2Q6PA06 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atl2Q6PA06 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Atl2Q6PA06 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atl2Q6PA06 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atl2Q6PA06 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atl2Q6PA06 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atl2Q6PA06 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atl2Q6PA06 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atl2Q6PA06 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atl2Q6PA06 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atl2Q6PA06 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atl2Q6PA06 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Atl2Q6PA06 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atl2Q6PA06 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atl2Q6PA06 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atl2Q6PA06 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atl2Q6PA06 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atl2Q6PA06 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Atl2Q6PA06 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atl2Q6PA06 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atl2Q6PA06 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atl2Q6PA06 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atl2Q6PA06 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atl2Q6PA06 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atl2Q6PA06 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atl2Q6PA06 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atl2Q6PA06 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Atl2Q6PA06 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atl2Q6PA06 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atl2Q6PA06 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms