Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Fhod1Q6P9Q4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,69■■■□□ 2,5
Fhod1Q6P9Q4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,68■■■□□ 2,5
Fhod1Q6P9Q4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Fhod1Q6P9Q4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Fhod1Q6P9Q4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Fhod1Q6P9Q4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Fhod1Q6P9Q4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Fhod1Q6P9Q4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,56■■■□□ 2,48
Fhod1Q6P9Q4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Fhod1Q6P9Q4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Fhod1Q6P9Q4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Fhod1Q6P9Q4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Fhod1Q6P9Q4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Fhod1Q6P9Q4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Fhod1Q6P9Q4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Fhod1Q6P9Q4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Fhod1Q6P9Q4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Fhod1Q6P9Q4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Fhod1Q6P9Q4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Fhod1Q6P9Q4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,24■■■□□ 2,43
Fhod1Q6P9Q4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Fhod1Q6P9Q4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Fhod1Q6P9Q4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Fhod1Q6P9Q4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Fhod1Q6P9Q4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Fhod1Q6P9Q4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Fhod1Q6P9Q4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Fhod1Q6P9Q4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Fhod1Q6P9Q4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Fhod1Q6P9Q4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Fhod1Q6P9Q4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Fhod1Q6P9Q4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Fhod1Q6P9Q4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Fhod1Q6P9Q4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Fhod1Q6P9Q4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Fhod1Q6P9Q4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Fhod1Q6P9Q4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Fhod1Q6P9Q4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Fhod1Q6P9Q4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Fhod1Q6P9Q4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Fhod1Q6P9Q4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Fhod1Q6P9Q4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Fhod1Q6P9Q4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Fhod1Q6P9Q4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Fhod1Q6P9Q4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Fhod1Q6P9Q4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Fhod1Q6P9Q4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Fhod1Q6P9Q4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Fhod1Q6P9Q4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Fhod1Q6P9Q4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Fhod1Q6P9Q4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Fhod1Q6P9Q4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Fhod1Q6P9Q4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Fhod1Q6P9Q4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Fhod1Q6P9Q4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Fhod1Q6P9Q4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Fhod1Q6P9Q4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Fhod1Q6P9Q4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Fhod1Q6P9Q4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Fhod1Q6P9Q4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,49■■■□□ 2,31
Fhod1Q6P9Q4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Fhod1Q6P9Q4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Fhod1Q6P9Q4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Fhod1Q6P9Q4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Fhod1Q6P9Q4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Fhod1Q6P9Q4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Fhod1Q6P9Q4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Fhod1Q6P9Q4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Fhod1Q6P9Q4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Fhod1Q6P9Q4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
Fhod1Q6P9Q4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Fhod1Q6P9Q4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Fhod1Q6P9Q4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Fhod1Q6P9Q4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Fhod1Q6P9Q4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Fhod1Q6P9Q4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Fhod1Q6P9Q4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,22■■■□□ 2,27
Fhod1Q6P9Q4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Fhod1Q6P9Q4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Fhod1Q6P9Q4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Fhod1Q6P9Q4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Fhod1Q6P9Q4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Fhod1Q6P9Q4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Fhod1Q6P9Q4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Fhod1Q6P9Q4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Fhod1Q6P9Q4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Fhod1Q6P9Q4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Fhod1Q6P9Q4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Fhod1Q6P9Q4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Fhod1Q6P9Q4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Fhod1Q6P9Q4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Fhod1Q6P9Q4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Fhod1Q6P9Q4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Fhod1Q6P9Q4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Fhod1Q6P9Q4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Fhod1Q6P9Q4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Fhod1Q6P9Q4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Fhod1Q6P9Q4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms