Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5G6

Ubxn7, UBX domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn7Q6P5G6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ubxn7Q6P5G6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn7Q6P5G6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ubxn7Q6P5G6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ubxn7Q6P5G6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn7Q6P5G6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn7Q6P5G6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubxn7Q6P5G6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ubxn7Q6P5G6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ubxn7Q6P5G6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn7Q6P5G6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubxn7Q6P5G6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ubxn7Q6P5G6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubxn7Q6P5G6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubxn7Q6P5G6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubxn7Q6P5G6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubxn7Q6P5G6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn7Q6P5G6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ubxn7Q6P5G6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ubxn7Q6P5G6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ubxn7Q6P5G6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ubxn7Q6P5G6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ubxn7Q6P5G6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ubxn7Q6P5G6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ubxn7Q6P5G6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ubxn7Q6P5G6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ubxn7Q6P5G6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ubxn7Q6P5G6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ubxn7Q6P5G6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ubxn7Q6P5G6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ubxn7Q6P5G6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ubxn7Q6P5G6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ubxn7Q6P5G6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubxn7Q6P5G6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubxn7Q6P5G6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubxn7Q6P5G6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ubxn7Q6P5G6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ubxn7Q6P5G6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubxn7Q6P5G6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubxn7Q6P5G6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubxn7Q6P5G6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubxn7Q6P5G6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubxn7Q6P5G6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubxn7Q6P5G6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubxn7Q6P5G6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubxn7Q6P5G6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ubxn7Q6P5G6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ubxn7Q6P5G6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ubxn7Q6P5G6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ubxn7Q6P5G6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ubxn7Q6P5G6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn7Q6P5G6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn7Q6P5G6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn7Q6P5G6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn7Q6P5G6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn7Q6P5G6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn7Q6P5G6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ubxn7Q6P5G6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ubxn7Q6P5G6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubxn7Q6P5G6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ubxn7Q6P5G6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ubxn7Q6P5G6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn7Q6P5G6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ubxn7Q6P5G6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubxn7Q6P5G6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ubxn7Q6P5G6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ubxn7Q6P5G6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ubxn7Q6P5G6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubxn7Q6P5G6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubxn7Q6P5G6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubxn7Q6P5G6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubxn7Q6P5G6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn7Q6P5G6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn7Q6P5G6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn7Q6P5G6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn7Q6P5G6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubxn7Q6P5G6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubxn7Q6P5G6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn7Q6P5G6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn7Q6P5G6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn7Q6P5G6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ubxn7Q6P5G6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn7Q6P5G6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn7Q6P5G6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubxn7Q6P5G6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn7Q6P5G6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubxn7Q6P5G6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubxn7Q6P5G6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn7Q6P5G6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubxn7Q6P5G6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubxn7Q6P5G6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn7Q6P5G6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubxn7Q6P5G6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubxn7Q6P5G6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn7Q6P5G6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn7Q6P5G6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn7Q6P5G6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn7Q6P5G6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn7Q6P5G6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn7Q6P5G6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms