Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE3

Spin2c, Spindlin-2C, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2cQ6NVE3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spin2cQ6NVE3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spin2cQ6NVE3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spin2cQ6NVE3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spin2cQ6NVE3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spin2cQ6NVE3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spin2cQ6NVE3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spin2cQ6NVE3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spin2cQ6NVE3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spin2cQ6NVE3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spin2cQ6NVE3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spin2cQ6NVE3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spin2cQ6NVE3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spin2cQ6NVE3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spin2cQ6NVE3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spin2cQ6NVE3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spin2cQ6NVE3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spin2cQ6NVE3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spin2cQ6NVE3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spin2cQ6NVE3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spin2cQ6NVE3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spin2cQ6NVE3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spin2cQ6NVE3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spin2cQ6NVE3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spin2cQ6NVE3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spin2cQ6NVE3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spin2cQ6NVE3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spin2cQ6NVE3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spin2cQ6NVE3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spin2cQ6NVE3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Spin2cQ6NVE3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Spin2cQ6NVE3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spin2cQ6NVE3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spin2cQ6NVE3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spin2cQ6NVE3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spin2cQ6NVE3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Spin2cQ6NVE3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spin2cQ6NVE3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Spin2cQ6NVE3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spin2cQ6NVE3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spin2cQ6NVE3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spin2cQ6NVE3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spin2cQ6NVE3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spin2cQ6NVE3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spin2cQ6NVE3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spin2cQ6NVE3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spin2cQ6NVE3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spin2cQ6NVE3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spin2cQ6NVE3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spin2cQ6NVE3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spin2cQ6NVE3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spin2cQ6NVE3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spin2cQ6NVE3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spin2cQ6NVE3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spin2cQ6NVE3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spin2cQ6NVE3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spin2cQ6NVE3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spin2cQ6NVE3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spin2cQ6NVE3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spin2cQ6NVE3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spin2cQ6NVE3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spin2cQ6NVE3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spin2cQ6NVE3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spin2cQ6NVE3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spin2cQ6NVE3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Spin2cQ6NVE3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spin2cQ6NVE3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spin2cQ6NVE3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spin2cQ6NVE3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spin2cQ6NVE3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spin2cQ6NVE3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spin2cQ6NVE3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spin2cQ6NVE3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spin2cQ6NVE3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spin2cQ6NVE3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spin2cQ6NVE3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spin2cQ6NVE3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spin2cQ6NVE3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spin2cQ6NVE3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spin2cQ6NVE3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spin2cQ6NVE3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Spin2cQ6NVE3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Spin2cQ6NVE3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Spin2cQ6NVE3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spin2cQ6NVE3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Spin2cQ6NVE3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spin2cQ6NVE3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spin2cQ6NVE3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spin2cQ6NVE3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spin2cQ6NVE3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spin2cQ6NVE3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spin2cQ6NVE3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spin2cQ6NVE3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spin2cQ6NVE3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spin2cQ6NVE3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spin2cQ6NVE3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spin2cQ6NVE3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Spin2cQ6NVE3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spin2cQ6NVE3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spin2cQ6NVE3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms