Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KdsrQ6GV12 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KdsrQ6GV12 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KdsrQ6GV12 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KdsrQ6GV12 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KdsrQ6GV12 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KdsrQ6GV12 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KdsrQ6GV12 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KdsrQ6GV12 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KdsrQ6GV12 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KdsrQ6GV12 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KdsrQ6GV12 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KdsrQ6GV12 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KdsrQ6GV12 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KdsrQ6GV12 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KdsrQ6GV12 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KdsrQ6GV12 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KdsrQ6GV12 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KdsrQ6GV12 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KdsrQ6GV12 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KdsrQ6GV12 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KdsrQ6GV12 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KdsrQ6GV12 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KdsrQ6GV12 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KdsrQ6GV12 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KdsrQ6GV12 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KdsrQ6GV12 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KdsrQ6GV12 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KdsrQ6GV12 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KdsrQ6GV12 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KdsrQ6GV12 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KdsrQ6GV12 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KdsrQ6GV12 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KdsrQ6GV12 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KdsrQ6GV12 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KdsrQ6GV12 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KdsrQ6GV12 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KdsrQ6GV12 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KdsrQ6GV12 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KdsrQ6GV12 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KdsrQ6GV12 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KdsrQ6GV12 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KdsrQ6GV12 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KdsrQ6GV12 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KdsrQ6GV12 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KdsrQ6GV12 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KdsrQ6GV12 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KdsrQ6GV12 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KdsrQ6GV12 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KdsrQ6GV12 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KdsrQ6GV12 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KdsrQ6GV12 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KdsrQ6GV12 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KdsrQ6GV12 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KdsrQ6GV12 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KdsrQ6GV12 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KdsrQ6GV12 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KdsrQ6GV12 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KdsrQ6GV12 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KdsrQ6GV12 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KdsrQ6GV12 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KdsrQ6GV12 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KdsrQ6GV12 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KdsrQ6GV12 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KdsrQ6GV12 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KdsrQ6GV12 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KdsrQ6GV12 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KdsrQ6GV12 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KdsrQ6GV12 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KdsrQ6GV12 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KdsrQ6GV12 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KdsrQ6GV12 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KdsrQ6GV12 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KdsrQ6GV12 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KdsrQ6GV12 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KdsrQ6GV12 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KdsrQ6GV12 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KdsrQ6GV12 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KdsrQ6GV12 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KdsrQ6GV12 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KdsrQ6GV12 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KdsrQ6GV12 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KdsrQ6GV12 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KdsrQ6GV12 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KdsrQ6GV12 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KdsrQ6GV12 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KdsrQ6GV12 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KdsrQ6GV12 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KdsrQ6GV12 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KdsrQ6GV12 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KdsrQ6GV12 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KdsrQ6GV12 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KdsrQ6GV12 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KdsrQ6GV12 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KdsrQ6GV12 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KdsrQ6GV12 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KdsrQ6GV12 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KdsrQ6GV12 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KdsrQ6GV12 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KdsrQ6GV12 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms