Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nlrp4eQ66X19 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nlrp4eQ66X19 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nlrp4eQ66X19 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nlrp4eQ66X19 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nlrp4eQ66X19 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nlrp4eQ66X19 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nlrp4eQ66X19 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nlrp4eQ66X19 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nlrp4eQ66X19 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nlrp4eQ66X19 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nlrp4eQ66X19 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nlrp4eQ66X19 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nlrp4eQ66X19 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nlrp4eQ66X19 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nlrp4eQ66X19 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nlrp4eQ66X19 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nlrp4eQ66X19 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlrp4eQ66X19 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nlrp4eQ66X19 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nlrp4eQ66X19 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp4eQ66X19 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp4eQ66X19 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlrp4eQ66X19 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlrp4eQ66X19 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlrp4eQ66X19 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlrp4eQ66X19 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp4eQ66X19 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp4eQ66X19 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp4eQ66X19 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlrp4eQ66X19 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp4eQ66X19 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlrp4eQ66X19 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp4eQ66X19 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp4eQ66X19 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp4eQ66X19 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nlrp4eQ66X19 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlrp4eQ66X19 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlrp4eQ66X19 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlrp4eQ66X19 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlrp4eQ66X19 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlrp4eQ66X19 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrp4eQ66X19 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nlrp4eQ66X19 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nlrp4eQ66X19 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nlrp4eQ66X19 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nlrp4eQ66X19 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nlrp4eQ66X19 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nlrp4eQ66X19 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nlrp4eQ66X19 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nlrp4eQ66X19 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nlrp4eQ66X19 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nlrp4eQ66X19 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nlrp4eQ66X19 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nlrp4eQ66X19 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nlrp4eQ66X19 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nlrp4eQ66X19 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nlrp4eQ66X19 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nlrp4eQ66X19 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nlrp4eQ66X19 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nlrp4eQ66X19 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nlrp4eQ66X19 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nlrp4eQ66X19 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nlrp4eQ66X19 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nlrp4eQ66X19 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nlrp4eQ66X19 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nlrp4eQ66X19 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nlrp4eQ66X19 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nlrp4eQ66X19 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Nlrp4eQ66X19 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlrp4eQ66X19 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlrp4eQ66X19 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlrp4eQ66X19 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlrp4eQ66X19 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp4eQ66X19 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp4eQ66X19 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlrp4eQ66X19 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nlrp4eQ66X19 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nlrp4eQ66X19 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nlrp4eQ66X19 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlrp4eQ66X19 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nlrp4eQ66X19 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Nlrp4eQ66X19 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nlrp4eQ66X19 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nlrp4eQ66X19 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nlrp4eQ66X19 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nlrp4eQ66X19 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nlrp4eQ66X19 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nlrp4eQ66X19 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms