Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nlrp4fQ66X05 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nlrp4fQ66X05 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nlrp4fQ66X05 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nlrp4fQ66X05 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlrp4fQ66X05 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlrp4fQ66X05 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nlrp4fQ66X05 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nlrp4fQ66X05 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nlrp4fQ66X05 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nlrp4fQ66X05 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nlrp4fQ66X05 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nlrp4fQ66X05 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nlrp4fQ66X05 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nlrp4fQ66X05 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nlrp4fQ66X05 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nlrp4fQ66X05 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nlrp4fQ66X05 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlrp4fQ66X05 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlrp4fQ66X05 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nlrp4fQ66X05 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nlrp4fQ66X05 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nlrp4fQ66X05 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Nlrp4fQ66X05 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nlrp4fQ66X05 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nlrp4fQ66X05 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nlrp4fQ66X05 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nlrp4fQ66X05 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nlrp4fQ66X05 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nlrp4fQ66X05 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlrp4fQ66X05 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlrp4fQ66X05 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlrp4fQ66X05 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp4fQ66X05 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp4fQ66X05 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp4fQ66X05 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp4fQ66X05 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp4fQ66X05 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp4fQ66X05 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp4fQ66X05 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlrp4fQ66X05 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlrp4fQ66X05 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp4fQ66X05 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp4fQ66X05 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp4fQ66X05 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp4fQ66X05 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Nlrp4fQ66X05 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Nlrp4fQ66X05 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlrp4fQ66X05 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlrp4fQ66X05 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlrp4fQ66X05 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nlrp4fQ66X05 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nlrp4fQ66X05 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nlrp4fQ66X05 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nlrp4fQ66X05 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nlrp4fQ66X05 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nlrp4fQ66X05 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nlrp4fQ66X05 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nlrp4fQ66X05 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nlrp4fQ66X05 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Nlrp4fQ66X05 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Nlrp4fQ66X05 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nlrp4fQ66X05 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nlrp4fQ66X05 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nlrp4fQ66X05 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nlrp4fQ66X05 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nlrp4fQ66X05 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nlrp4fQ66X05 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nlrp4fQ66X05 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nlrp4fQ66X05 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nlrp4fQ66X05 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nlrp4fQ66X05 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nlrp4fQ66X05 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nlrp4fQ66X05 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nlrp4fQ66X05 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nlrp4fQ66X05 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nlrp4fQ66X05 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nlrp4fQ66X05 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nlrp4fQ66X05 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlrp4fQ66X05 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlrp4fQ66X05 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlrp4fQ66X05 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nlrp4fQ66X05 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp4fQ66X05 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp4fQ66X05 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlrp4fQ66X05 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nlrp4fQ66X05 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nlrp4fQ66X05 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nlrp4fQ66X05 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlrp4fQ66X05 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlrp4fQ66X05 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nlrp4fQ66X05 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Nlrp4fQ66X05 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nlrp4fQ66X05 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nlrp4fQ66X05 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nlrp4fQ66X05 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nlrp4fQ66X05 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nlrp4fQ66X05 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nlrp4fQ66X05 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nlrp4fQ66X05 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.1 ms