Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Q66JV7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Q66JV7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Q66JV7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Q66JV7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Q66JV7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Q66JV7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Q66JV7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Q66JV7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,3
Q66JV7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Q66JV7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Q66JV7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Q66JV7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,29
Q66JV7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Q66JV7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Q66JV7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Q66JV7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Q66JV7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Q66JV7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Q66JV7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Q66JV7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Q66JV7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Q66JV7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Q66JV7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,27
Q66JV7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Q66JV7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Q66JV7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Q66JV7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Q66JV7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Q66JV7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Q66JV7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Q66JV7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Q66JV7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Q66JV7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Q66JV7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Q66JV7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Q66JV7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Q66JV7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Q66JV7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Q66JV7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Q66JV7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Q66JV7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Q66JV7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,8■■■□□ 2,2
Q66JV7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Q66JV7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Q66JV7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Q66JV7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Q66JV7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Q66JV7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Q66JV7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Q66JV7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Q66JV7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Q66JV7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Q66JV7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Q66JV7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Q66JV7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Q66JV7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Q66JV7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,58■■■□□ 2,17
Q66JV7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Q66JV7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Q66JV7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Q66JV7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Q66JV7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Q66JV7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Q66JV7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Q66JV7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Q66JV7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Q66JV7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Q66JV7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Q66JV7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Q66JV7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Q66JV7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
Q66JV7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Q66JV7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,43■■■□□ 2,14
Q66JV7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Q66JV7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Q66JV7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Q66JV7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Q66JV7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Q66JV7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Q66JV7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Q66JV7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Q66JV7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Q66JV7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Q66JV7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Q66JV7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Q66JV7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Q66JV7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Q66JV7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Q66JV7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Q66JV7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Q66JV7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Q66JV7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Q66JV7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Q66JV7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Q66JV7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Q66JV7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,16■■■□□ 2,1
Q66JV7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Q66JV7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Q66JV7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms