Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pan3Q640Q5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pan3Q640Q5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pan3Q640Q5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pan3Q640Q5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pan3Q640Q5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pan3Q640Q5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pan3Q640Q5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pan3Q640Q5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pan3Q640Q5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pan3Q640Q5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pan3Q640Q5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pan3Q640Q5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pan3Q640Q5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pan3Q640Q5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pan3Q640Q5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pan3Q640Q5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pan3Q640Q5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pan3Q640Q5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pan3Q640Q5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pan3Q640Q5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pan3Q640Q5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pan3Q640Q5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pan3Q640Q5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pan3Q640Q5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pan3Q640Q5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pan3Q640Q5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pan3Q640Q5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pan3Q640Q5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pan3Q640Q5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pan3Q640Q5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pan3Q640Q5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pan3Q640Q5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pan3Q640Q5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pan3Q640Q5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pan3Q640Q5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pan3Q640Q5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pan3Q640Q5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pan3Q640Q5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pan3Q640Q5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pan3Q640Q5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pan3Q640Q5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pan3Q640Q5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pan3Q640Q5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pan3Q640Q5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pan3Q640Q5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pan3Q640Q5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pan3Q640Q5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pan3Q640Q5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pan3Q640Q5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pan3Q640Q5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pan3Q640Q5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pan3Q640Q5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pan3Q640Q5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pan3Q640Q5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pan3Q640Q5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pan3Q640Q5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pan3Q640Q5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pan3Q640Q5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pan3Q640Q5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pan3Q640Q5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pan3Q640Q5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pan3Q640Q5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pan3Q640Q5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pan3Q640Q5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pan3Q640Q5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pan3Q640Q5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pan3Q640Q5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pan3Q640Q5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pan3Q640Q5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pan3Q640Q5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pan3Q640Q5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pan3Q640Q5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pan3Q640Q5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pan3Q640Q5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pan3Q640Q5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pan3Q640Q5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pan3Q640Q5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pan3Q640Q5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pan3Q640Q5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pan3Q640Q5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pan3Q640Q5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pan3Q640Q5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pan3Q640Q5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pan3Q640Q5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pan3Q640Q5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pan3Q640Q5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pan3Q640Q5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pan3Q640Q5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pan3Q640Q5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pan3Q640Q5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pan3Q640Q5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pan3Q640Q5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pan3Q640Q5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pan3Q640Q5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pan3Q640Q5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pan3Q640Q5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pan3Q640Q5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pan3Q640Q5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pan3Q640Q5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
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