Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SnrpcQ62241 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SnrpcQ62241 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SnrpcQ62241 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SnrpcQ62241 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpcQ62241 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpcQ62241 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpcQ62241 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SnrpcQ62241 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SnrpcQ62241 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SnrpcQ62241 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SnrpcQ62241 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SnrpcQ62241 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SnrpcQ62241 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SnrpcQ62241 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SnrpcQ62241 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SnrpcQ62241 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SnrpcQ62241 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SnrpcQ62241 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SnrpcQ62241 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SnrpcQ62241 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SnrpcQ62241 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SnrpcQ62241 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SnrpcQ62241 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SnrpcQ62241 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SnrpcQ62241 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SnrpcQ62241 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SnrpcQ62241 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SnrpcQ62241 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnrpcQ62241 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnrpcQ62241 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnrpcQ62241 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SnrpcQ62241 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpcQ62241 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpcQ62241 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnrpcQ62241 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpcQ62241 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpcQ62241 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpcQ62241 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpcQ62241 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpcQ62241 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpcQ62241 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpcQ62241 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpcQ62241 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpcQ62241 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpcQ62241 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpcQ62241 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnrpcQ62241 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnrpcQ62241 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnrpcQ62241 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnrpcQ62241 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnrpcQ62241 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpcQ62241 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpcQ62241 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpcQ62241 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpcQ62241 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpcQ62241 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpcQ62241 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpcQ62241 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpcQ62241 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpcQ62241 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnrpcQ62241 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnrpcQ62241 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpcQ62241 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpcQ62241 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpcQ62241 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnrpcQ62241 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnrpcQ62241 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnrpcQ62241 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpcQ62241 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnrpcQ62241 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnrpcQ62241 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SnrpcQ62241 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SnrpcQ62241 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnrpcQ62241 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SnrpcQ62241 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SnrpcQ62241 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SnrpcQ62241 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnrpcQ62241 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnrpcQ62241 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SnrpcQ62241 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SnrpcQ62241 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SnrpcQ62241 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SnrpcQ62241 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SnrpcQ62241 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SnrpcQ62241 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SnrpcQ62241 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SnrpcQ62241 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SnrpcQ62241 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SnrpcQ62241 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SnrpcQ62241 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SnrpcQ62241 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SnrpcQ62241 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SnrpcQ62241 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SnrpcQ62241 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SnrpcQ62241 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SnrpcQ62241 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SnrpcQ62241 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SnrpcQ62241 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SnrpcQ62241 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms