Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrn1Q61809 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrn1Q61809 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrn1Q61809 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrn1Q61809 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrn1Q61809 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrn1Q61809 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrn1Q61809 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrn1Q61809 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrn1Q61809 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrn1Q61809 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrn1Q61809 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrn1Q61809 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrn1Q61809 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrn1Q61809 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrn1Q61809 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrn1Q61809 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrn1Q61809 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrn1Q61809 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrn1Q61809 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrn1Q61809 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrn1Q61809 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrn1Q61809 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrn1Q61809 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrn1Q61809 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrn1Q61809 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrn1Q61809 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrn1Q61809 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrn1Q61809 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrn1Q61809 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrn1Q61809 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrn1Q61809 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrn1Q61809 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrn1Q61809 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrn1Q61809 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrn1Q61809 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrn1Q61809 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrn1Q61809 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrn1Q61809 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrn1Q61809 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrn1Q61809 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrn1Q61809 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrn1Q61809 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrn1Q61809 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrn1Q61809 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrn1Q61809 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrn1Q61809 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrn1Q61809 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrn1Q61809 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrn1Q61809 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrn1Q61809 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrn1Q61809 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrn1Q61809 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrn1Q61809 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrn1Q61809 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrn1Q61809 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrn1Q61809 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrn1Q61809 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrn1Q61809 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrn1Q61809 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrn1Q61809 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrn1Q61809 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrn1Q61809 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrn1Q61809 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrn1Q61809 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrn1Q61809 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrn1Q61809 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrn1Q61809 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrn1Q61809 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrn1Q61809 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrn1Q61809 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrn1Q61809 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrn1Q61809 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrn1Q61809 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrn1Q61809 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrn1Q61809 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrn1Q61809 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrn1Q61809 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrn1Q61809 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrn1Q61809 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrn1Q61809 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrn1Q61809 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrn1Q61809 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrn1Q61809 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrn1Q61809 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrn1Q61809 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrn1Q61809 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrn1Q61809 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrn1Q61809 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrn1Q61809 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrn1Q61809 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrn1Q61809 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrn1Q61809 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lrrn1Q61809 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrn1Q61809 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrn1Q61809 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrn1Q61809 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrn1Q61809 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrn1Q61809 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrn1Q61809 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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