Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itga7Q61738 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Itga7Q61738 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itga7Q61738 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itga7Q61738 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Itga7Q61738 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Itga7Q61738 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itga7Q61738 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itga7Q61738 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Itga7Q61738 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Itga7Q61738 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Itga7Q61738 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Itga7Q61738 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Itga7Q61738 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Itga7Q61738 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Itga7Q61738 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Itga7Q61738 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Itga7Q61738 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Itga7Q61738 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Itga7Q61738 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Itga7Q61738 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Itga7Q61738 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Itga7Q61738 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Itga7Q61738 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Itga7Q61738 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itga7Q61738 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Itga7Q61738 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Itga7Q61738 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Itga7Q61738 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itga7Q61738 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Itga7Q61738 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Itga7Q61738 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itga7Q61738 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Itga7Q61738 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itga7Q61738 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itga7Q61738 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itga7Q61738 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itga7Q61738 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itga7Q61738 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itga7Q61738 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Itga7Q61738 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itga7Q61738 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Itga7Q61738 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Itga7Q61738 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Itga7Q61738 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Itga7Q61738 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Itga7Q61738 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Itga7Q61738 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Itga7Q61738 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Itga7Q61738 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Itga7Q61738 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Itga7Q61738 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Itga7Q61738 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Itga7Q61738 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Itga7Q61738 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Itga7Q61738 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Itga7Q61738 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itga7Q61738 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Itga7Q61738 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Itga7Q61738 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itga7Q61738 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itga7Q61738 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itga7Q61738 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itga7Q61738 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itga7Q61738 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itga7Q61738 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itga7Q61738 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itga7Q61738 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Itga7Q61738 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Itga7Q61738 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itga7Q61738 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itga7Q61738 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Itga7Q61738 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itga7Q61738 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itga7Q61738 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Itga7Q61738 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itga7Q61738 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itga7Q61738 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itga7Q61738 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itga7Q61738 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itga7Q61738 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Itga7Q61738 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itga7Q61738 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itga7Q61738 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itga7Q61738 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itga7Q61738 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itga7Q61738 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itga7Q61738 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itga7Q61738 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Itga7Q61738 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Itga7Q61738 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Itga7Q61738 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Itga7Q61738 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Itga7Q61738 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Itga7Q61738 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Itga7Q61738 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Itga7Q61738 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Itga7Q61738 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Itga7Q61738 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Itga7Q61738 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms