Protein–RNA interactions for Protein: Q61645

Hr, Lysine-specific demethylase hairless, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrQ61645 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
HrQ61645 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
HrQ61645 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
HrQ61645 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
HrQ61645 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
HrQ61645 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,07■■■□□ 2,24
HrQ61645 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
HrQ61645 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
HrQ61645 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
HrQ61645 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
HrQ61645 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
HrQ61645 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
HrQ61645 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
HrQ61645 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,87■■■□□ 2,21
HrQ61645 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
HrQ61645 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
HrQ61645 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
HrQ61645 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
HrQ61645 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
HrQ61645 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,78■■■□□ 2,2
HrQ61645 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
HrQ61645 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
HrQ61645 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
HrQ61645 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
HrQ61645 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
HrQ61645 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
HrQ61645 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
HrQ61645 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,6■■■□□ 2,17
HrQ61645 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
HrQ61645 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
HrQ61645 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
HrQ61645 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
HrQ61645 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,53■■■□□ 2,16
HrQ61645 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
HrQ61645 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,49■■■□□ 2,15
HrQ61645 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
HrQ61645 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
HrQ61645 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
HrQ61645 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
HrQ61645 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
HrQ61645 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
HrQ61645 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
HrQ61645 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
HrQ61645 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
HrQ61645 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
HrQ61645 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
HrQ61645 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
HrQ61645 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
HrQ61645 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,24■■■□□ 2,11
HrQ61645 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
HrQ61645 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,23■■■□□ 2,11
HrQ61645 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
HrQ61645 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,11
HrQ61645 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
HrQ61645 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
HrQ61645 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
HrQ61645 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
HrQ61645 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,16■■■□□ 2,1
HrQ61645 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
HrQ61645 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
HrQ61645 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
HrQ61645 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
HrQ61645 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
HrQ61645 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
HrQ61645 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
HrQ61645 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
HrQ61645 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,98■■■□□ 2,07
HrQ61645 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
HrQ61645 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,94■■■□□ 2,06
HrQ61645 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
HrQ61645 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
HrQ61645 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
HrQ61645 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
HrQ61645 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
HrQ61645 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
HrQ61645 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,84■■■□□ 2,05
HrQ61645 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
HrQ61645 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
HrQ61645 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
HrQ61645 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
HrQ61645 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
HrQ61645 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
HrQ61645 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
HrQ61645 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
HrQ61645 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
HrQ61645 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
HrQ61645 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,74■■■□□ 2,03
HrQ61645 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
HrQ61645 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
HrQ61645 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
HrQ61645 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
HrQ61645 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
HrQ61645 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,71■■■□□ 2,03
HrQ61645 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
HrQ61645 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
HrQ61645 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
HrQ61645 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
HrQ61645 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
HrQ61645 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
HrQ61645 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms