Protein–RNA interactions for Protein: Q61645

Hr, Lysine-specific demethylase hairless, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrQ61645 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HrQ61645 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HrQ61645 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HrQ61645 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HrQ61645 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HrQ61645 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HrQ61645 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HrQ61645 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
HrQ61645 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HrQ61645 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HrQ61645 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HrQ61645 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HrQ61645 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HrQ61645 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HrQ61645 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HrQ61645 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HrQ61645 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HrQ61645 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HrQ61645 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HrQ61645 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HrQ61645 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HrQ61645 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HrQ61645 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HrQ61645 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HrQ61645 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HrQ61645 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HrQ61645 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HrQ61645 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HrQ61645 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HrQ61645 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HrQ61645 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HrQ61645 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HrQ61645 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HrQ61645 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HrQ61645 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HrQ61645 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HrQ61645 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HrQ61645 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HrQ61645 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HrQ61645 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HrQ61645 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HrQ61645 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HrQ61645 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HrQ61645 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HrQ61645 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HrQ61645 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HrQ61645 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HrQ61645 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HrQ61645 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HrQ61645 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HrQ61645 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HrQ61645 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HrQ61645 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HrQ61645 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HrQ61645 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HrQ61645 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HrQ61645 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HrQ61645 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HrQ61645 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HrQ61645 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HrQ61645 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HrQ61645 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HrQ61645 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HrQ61645 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HrQ61645 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HrQ61645 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HrQ61645 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HrQ61645 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HrQ61645 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HrQ61645 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HrQ61645 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HrQ61645 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HrQ61645 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HrQ61645 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HrQ61645 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HrQ61645 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HrQ61645 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HrQ61645 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HrQ61645 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HrQ61645 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HrQ61645 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HrQ61645 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HrQ61645 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HrQ61645 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HrQ61645 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HrQ61645 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HrQ61645 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HrQ61645 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HrQ61645 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HrQ61645 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HrQ61645 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HrQ61645 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HrQ61645 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HrQ61645 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HrQ61645 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HrQ61645 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HrQ61645 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HrQ61645 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HrQ61645 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HrQ61645 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms