Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gbp4Q61107 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gbp4Q61107 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gbp4Q61107 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gbp4Q61107 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gbp4Q61107 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gbp4Q61107 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gbp4Q61107 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gbp4Q61107 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gbp4Q61107 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gbp4Q61107 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gbp4Q61107 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gbp4Q61107 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gbp4Q61107 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gbp4Q61107 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gbp4Q61107 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gbp4Q61107 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gbp4Q61107 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gbp4Q61107 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gbp4Q61107 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gbp4Q61107 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gbp4Q61107 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gbp4Q61107 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gbp4Q61107 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Gbp4Q61107 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gbp4Q61107 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gbp4Q61107 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gbp4Q61107 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gbp4Q61107 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gbp4Q61107 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Gbp4Q61107 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gbp4Q61107 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gbp4Q61107 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gbp4Q61107 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gbp4Q61107 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gbp4Q61107 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gbp4Q61107 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gbp4Q61107 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gbp4Q61107 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gbp4Q61107 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gbp4Q61107 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gbp4Q61107 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gbp4Q61107 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gbp4Q61107 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gbp4Q61107 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gbp4Q61107 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gbp4Q61107 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gbp4Q61107 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gbp4Q61107 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gbp4Q61107 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gbp4Q61107 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gbp4Q61107 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gbp4Q61107 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gbp4Q61107 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gbp4Q61107 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gbp4Q61107 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Gbp4Q61107 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gbp4Q61107 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gbp4Q61107 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gbp4Q61107 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gbp4Q61107 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gbp4Q61107 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gbp4Q61107 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Gbp4Q61107 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gbp4Q61107 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gbp4Q61107 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gbp4Q61107 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gbp4Q61107 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gbp4Q61107 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gbp4Q61107 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Gbp4Q61107 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gbp4Q61107 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gbp4Q61107 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gbp4Q61107 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gbp4Q61107 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gbp4Q61107 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gbp4Q61107 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gbp4Q61107 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gbp4Q61107 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gbp4Q61107 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Gbp4Q61107 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Gbp4Q61107 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gbp4Q61107 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Gbp4Q61107 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gbp4Q61107 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gbp4Q61107 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gbp4Q61107 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gbp4Q61107 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gbp4Q61107 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gbp4Q61107 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gbp4Q61107 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gbp4Q61107 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gbp4Q61107 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gbp4Q61107 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gbp4Q61107 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gbp4Q61107 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gbp4Q61107 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gbp4Q61107 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gbp4Q61107 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gbp4Q61107 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms