Protein–RNA interactions for Protein: Q61048

Wbp4, WW domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wbp4Q61048 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Wbp4Q61048 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Wbp4Q61048 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Wbp4Q61048 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Wbp4Q61048 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Wbp4Q61048 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Wbp4Q61048 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Wbp4Q61048 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Wbp4Q61048 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Wbp4Q61048 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Wbp4Q61048 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Wbp4Q61048 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Wbp4Q61048 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Wbp4Q61048 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Wbp4Q61048 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Wbp4Q61048 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Wbp4Q61048 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Wbp4Q61048 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Wbp4Q61048 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Wbp4Q61048 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Wbp4Q61048 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Wbp4Q61048 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Wbp4Q61048 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Wbp4Q61048 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Wbp4Q61048 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Wbp4Q61048 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Wbp4Q61048 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Wbp4Q61048 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Wbp4Q61048 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Wbp4Q61048 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Wbp4Q61048 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Wbp4Q61048 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Wbp4Q61048 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Wbp4Q61048 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Wbp4Q61048 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Wbp4Q61048 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Wbp4Q61048 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Wbp4Q61048 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Wbp4Q61048 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Wbp4Q61048 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Wbp4Q61048 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Wbp4Q61048 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wbp4Q61048 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wbp4Q61048 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Wbp4Q61048 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Wbp4Q61048 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Wbp4Q61048 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Wbp4Q61048 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wbp4Q61048 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wbp4Q61048 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wbp4Q61048 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wbp4Q61048 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Wbp4Q61048 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Wbp4Q61048 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Wbp4Q61048 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Wbp4Q61048 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wbp4Q61048 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Wbp4Q61048 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Wbp4Q61048 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Wbp4Q61048 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Wbp4Q61048 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Wbp4Q61048 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Wbp4Q61048 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Wbp4Q61048 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Wbp4Q61048 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Wbp4Q61048 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Wbp4Q61048 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Wbp4Q61048 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Wbp4Q61048 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Wbp4Q61048 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Wbp4Q61048 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Wbp4Q61048 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Wbp4Q61048 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wbp4Q61048 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wbp4Q61048 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wbp4Q61048 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wbp4Q61048 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wbp4Q61048 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wbp4Q61048 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Wbp4Q61048 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wbp4Q61048 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wbp4Q61048 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wbp4Q61048 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wbp4Q61048 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wbp4Q61048 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Wbp4Q61048 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Wbp4Q61048 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wbp4Q61048 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Wbp4Q61048 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Wbp4Q61048 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Wbp4Q61048 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Wbp4Q61048 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Wbp4Q61048 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wbp4Q61048 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wbp4Q61048 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Wbp4Q61048 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wbp4Q61048 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wbp4Q61048 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Wbp4Q61048 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Wbp4Q61048 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms