Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scarb1Q61009 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scarb1Q61009 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scarb1Q61009 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scarb1Q61009 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scarb1Q61009 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scarb1Q61009 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scarb1Q61009 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scarb1Q61009 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scarb1Q61009 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scarb1Q61009 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scarb1Q61009 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scarb1Q61009 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scarb1Q61009 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scarb1Q61009 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scarb1Q61009 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scarb1Q61009 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Scarb1Q61009 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scarb1Q61009 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scarb1Q61009 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarb1Q61009 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarb1Q61009 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scarb1Q61009 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scarb1Q61009 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scarb1Q61009 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scarb1Q61009 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scarb1Q61009 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scarb1Q61009 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scarb1Q61009 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scarb1Q61009 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Scarb1Q61009 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scarb1Q61009 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scarb1Q61009 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scarb1Q61009 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scarb1Q61009 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scarb1Q61009 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scarb1Q61009 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scarb1Q61009 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scarb1Q61009 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Scarb1Q61009 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarb1Q61009 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarb1Q61009 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarb1Q61009 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scarb1Q61009 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scarb1Q61009 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarb1Q61009 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scarb1Q61009 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scarb1Q61009 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scarb1Q61009 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scarb1Q61009 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarb1Q61009 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarb1Q61009 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarb1Q61009 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarb1Q61009 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarb1Q61009 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scarb1Q61009 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scarb1Q61009 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Scarb1Q61009 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarb1Q61009 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scarb1Q61009 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Scarb1Q61009 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scarb1Q61009 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scarb1Q61009 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scarb1Q61009 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarb1Q61009 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarb1Q61009 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scarb1Q61009 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarb1Q61009 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scarb1Q61009 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scarb1Q61009 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scarb1Q61009 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scarb1Q61009 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scarb1Q61009 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scarb1Q61009 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarb1Q61009 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarb1Q61009 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarb1Q61009 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scarb1Q61009 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarb1Q61009 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarb1Q61009 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarb1Q61009 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarb1Q61009 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarb1Q61009 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scarb1Q61009 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarb1Q61009 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarb1Q61009 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarb1Q61009 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarb1Q61009 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarb1Q61009 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarb1Q61009 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarb1Q61009 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarb1Q61009 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scarb1Q61009 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scarb1Q61009 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarb1Q61009 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarb1Q61009 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scarb1Q61009 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scarb1Q61009 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scarb1Q61009 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarb1Q61009 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms